Protein–RNA interactions for Protein: Q3URY0

Rtl4, Retrotransposon Gag-like protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl4Q3URY0 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rtl4Q3URY0 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rtl4Q3URY0 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rtl4Q3URY0 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rtl4Q3URY0 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rtl4Q3URY0 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rtl4Q3URY0 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rtl4Q3URY0 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Rtl4Q3URY0 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rtl4Q3URY0 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rtl4Q3URY0 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rtl4Q3URY0 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rtl4Q3URY0 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rtl4Q3URY0 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rtl4Q3URY0 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rtl4Q3URY0 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rtl4Q3URY0 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rtl4Q3URY0 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rtl4Q3URY0 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rtl4Q3URY0 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rtl4Q3URY0 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rtl4Q3URY0 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rtl4Q3URY0 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rtl4Q3URY0 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rtl4Q3URY0 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rtl4Q3URY0 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rtl4Q3URY0 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rtl4Q3URY0 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rtl4Q3URY0 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rtl4Q3URY0 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rtl4Q3URY0 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rtl4Q3URY0 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rtl4Q3URY0 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rtl4Q3URY0 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rtl4Q3URY0 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rtl4Q3URY0 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rtl4Q3URY0 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rtl4Q3URY0 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rtl4Q3URY0 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rtl4Q3URY0 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rtl4Q3URY0 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rtl4Q3URY0 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rtl4Q3URY0 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rtl4Q3URY0 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Rtl4Q3URY0 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rtl4Q3URY0 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rtl4Q3URY0 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rtl4Q3URY0 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rtl4Q3URY0 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rtl4Q3URY0 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rtl4Q3URY0 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rtl4Q3URY0 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rtl4Q3URY0 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rtl4Q3URY0 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rtl4Q3URY0 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Rtl4Q3URY0 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rtl4Q3URY0 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rtl4Q3URY0 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rtl4Q3URY0 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rtl4Q3URY0 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rtl4Q3URY0 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rtl4Q3URY0 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rtl4Q3URY0 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rtl4Q3URY0 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rtl4Q3URY0 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rtl4Q3URY0 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rtl4Q3URY0 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rtl4Q3URY0 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rtl4Q3URY0 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rtl4Q3URY0 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rtl4Q3URY0 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rtl4Q3URY0 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rtl4Q3URY0 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rtl4Q3URY0 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rtl4Q3URY0 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rtl4Q3URY0 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rtl4Q3URY0 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rtl4Q3URY0 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rtl4Q3URY0 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rtl4Q3URY0 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rtl4Q3URY0 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rtl4Q3URY0 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rtl4Q3URY0 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rtl4Q3URY0 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rtl4Q3URY0 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rtl4Q3URY0 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rtl4Q3URY0 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rtl4Q3URY0 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rtl4Q3URY0 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rtl4Q3URY0 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rtl4Q3URY0 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rtl4Q3URY0 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rtl4Q3URY0 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rtl4Q3URY0 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rtl4Q3URY0 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rtl4Q3URY0 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rtl4Q3URY0 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rtl4Q3URY0 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rtl4Q3URY0 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rtl4Q3URY0 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms