Protein–RNA interactions for Protein: Q3URS2

Zscan4f, Zinc finger and SCAN domain containing protein 4F, mousemouse

Predictions only

Length 506 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zscan4fQ3URS2 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zscan4fQ3URS2 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zscan4fQ3URS2 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zscan4fQ3URS2 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Zscan4fQ3URS2 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zscan4fQ3URS2 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zscan4fQ3URS2 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zscan4fQ3URS2 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zscan4fQ3URS2 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zscan4fQ3URS2 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Zscan4fQ3URS2 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Zscan4fQ3URS2 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Zscan4fQ3URS2 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Zscan4fQ3URS2 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Zscan4fQ3URS2 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Zscan4fQ3URS2 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Zscan4fQ3URS2 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Zscan4fQ3URS2 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Zscan4fQ3URS2 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Zscan4fQ3URS2 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zscan4fQ3URS2 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zscan4fQ3URS2 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zscan4fQ3URS2 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zscan4fQ3URS2 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zscan4fQ3URS2 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zscan4fQ3URS2 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zscan4fQ3URS2 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zscan4fQ3URS2 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zscan4fQ3URS2 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zscan4fQ3URS2 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Zscan4fQ3URS2 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Zscan4fQ3URS2 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Zscan4fQ3URS2 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Zscan4fQ3URS2 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Zscan4fQ3URS2 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Zscan4fQ3URS2 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Zscan4fQ3URS2 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Zscan4fQ3URS2 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Zscan4fQ3URS2 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Zscan4fQ3URS2 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Zscan4fQ3URS2 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Zscan4fQ3URS2 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Zscan4fQ3URS2 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Zscan4fQ3URS2 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Zscan4fQ3URS2 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Zscan4fQ3URS2 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Zscan4fQ3URS2 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Zscan4fQ3URS2 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Zscan4fQ3URS2 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Zscan4fQ3URS2 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Zscan4fQ3URS2 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Zscan4fQ3URS2 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Zscan4fQ3URS2 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Zscan4fQ3URS2 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Zscan4fQ3URS2 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Zscan4fQ3URS2 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Zscan4fQ3URS2 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Zscan4fQ3URS2 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Zscan4fQ3URS2 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zscan4fQ3URS2 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zscan4fQ3URS2 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zscan4fQ3URS2 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zscan4fQ3URS2 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zscan4fQ3URS2 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Zscan4fQ3URS2 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zscan4fQ3URS2 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zscan4fQ3URS2 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zscan4fQ3URS2 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Zscan4fQ3URS2 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zscan4fQ3URS2 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zscan4fQ3URS2 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zscan4fQ3URS2 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zscan4fQ3URS2 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zscan4fQ3URS2 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zscan4fQ3URS2 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zscan4fQ3URS2 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zscan4fQ3URS2 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zscan4fQ3URS2 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zscan4fQ3URS2 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zscan4fQ3URS2 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Zscan4fQ3URS2 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Zscan4fQ3URS2 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Zscan4fQ3URS2 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zscan4fQ3URS2 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zscan4fQ3URS2 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zscan4fQ3URS2 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zscan4fQ3URS2 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Zscan4fQ3URS2 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zscan4fQ3URS2 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zscan4fQ3URS2 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zscan4fQ3URS2 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zscan4fQ3URS2 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zscan4fQ3URS2 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zscan4fQ3URS2 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zscan4fQ3URS2 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zscan4fQ3URS2 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zscan4fQ3URS2 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zscan4fQ3URS2 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zscan4fQ3URS2 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Zscan4fQ3URS2 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms