Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPL0

Sec31a, Protein transport protein Sec31A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec31aQ3UPL0 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sec31aQ3UPL0 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sec31aQ3UPL0 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sec31aQ3UPL0 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sec31aQ3UPL0 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sec31aQ3UPL0 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sec31aQ3UPL0 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sec31aQ3UPL0 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sec31aQ3UPL0 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sec31aQ3UPL0 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sec31aQ3UPL0 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sec31aQ3UPL0 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sec31aQ3UPL0 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sec31aQ3UPL0 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sec31aQ3UPL0 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sec31aQ3UPL0 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sec31aQ3UPL0 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sec31aQ3UPL0 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sec31aQ3UPL0 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sec31aQ3UPL0 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sec31aQ3UPL0 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sec31aQ3UPL0 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sec31aQ3UPL0 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sec31aQ3UPL0 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sec31aQ3UPL0 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sec31aQ3UPL0 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sec31aQ3UPL0 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sec31aQ3UPL0 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sec31aQ3UPL0 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sec31aQ3UPL0 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sec31aQ3UPL0 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sec31aQ3UPL0 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Sec31aQ3UPL0 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sec31aQ3UPL0 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sec31aQ3UPL0 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sec31aQ3UPL0 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sec31aQ3UPL0 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sec31aQ3UPL0 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sec31aQ3UPL0 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sec31aQ3UPL0 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Sec31aQ3UPL0 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sec31aQ3UPL0 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sec31aQ3UPL0 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sec31aQ3UPL0 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sec31aQ3UPL0 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sec31aQ3UPL0 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sec31aQ3UPL0 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sec31aQ3UPL0 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Sec31aQ3UPL0 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sec31aQ3UPL0 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sec31aQ3UPL0 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sec31aQ3UPL0 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sec31aQ3UPL0 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sec31aQ3UPL0 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sec31aQ3UPL0 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sec31aQ3UPL0 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sec31aQ3UPL0 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sec31aQ3UPL0 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sec31aQ3UPL0 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sec31aQ3UPL0 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sec31aQ3UPL0 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sec31aQ3UPL0 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sec31aQ3UPL0 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sec31aQ3UPL0 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sec31aQ3UPL0 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sec31aQ3UPL0 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sec31aQ3UPL0 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Sec31aQ3UPL0 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sec31aQ3UPL0 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sec31aQ3UPL0 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sec31aQ3UPL0 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sec31aQ3UPL0 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sec31aQ3UPL0 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sec31aQ3UPL0 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sec31aQ3UPL0 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sec31aQ3UPL0 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sec31aQ3UPL0 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sec31aQ3UPL0 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sec31aQ3UPL0 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sec31aQ3UPL0 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Sec31aQ3UPL0 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sec31aQ3UPL0 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sec31aQ3UPL0 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sec31aQ3UPL0 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sec31aQ3UPL0 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sec31aQ3UPL0 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sec31aQ3UPL0 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sec31aQ3UPL0 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sec31aQ3UPL0 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sec31aQ3UPL0 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sec31aQ3UPL0 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sec31aQ3UPL0 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sec31aQ3UPL0 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sec31aQ3UPL0 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sec31aQ3UPL0 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sec31aQ3UPL0 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sec31aQ3UPL0 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Sec31aQ3UPL0 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sec31aQ3UPL0 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sec31aQ3UPL0 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
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