Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW6

Ccdc33, Coiled-coil domain-containing protein 33, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc33Q3ULW6 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc33Q3ULW6 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc33Q3ULW6 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc33Q3ULW6 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc33Q3ULW6 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc33Q3ULW6 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc33Q3ULW6 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc33Q3ULW6 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc33Q3ULW6 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc33Q3ULW6 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc33Q3ULW6 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc33Q3ULW6 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc33Q3ULW6 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc33Q3ULW6 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc33Q3ULW6 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc33Q3ULW6 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc33Q3ULW6 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc33Q3ULW6 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc33Q3ULW6 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc33Q3ULW6 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc33Q3ULW6 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc33Q3ULW6 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc33Q3ULW6 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc33Q3ULW6 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc33Q3ULW6 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc33Q3ULW6 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc33Q3ULW6 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc33Q3ULW6 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc33Q3ULW6 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc33Q3ULW6 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc33Q3ULW6 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc33Q3ULW6 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ccdc33Q3ULW6 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc33Q3ULW6 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc33Q3ULW6 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc33Q3ULW6 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc33Q3ULW6 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc33Q3ULW6 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc33Q3ULW6 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc33Q3ULW6 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc33Q3ULW6 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc33Q3ULW6 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc33Q3ULW6 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc33Q3ULW6 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc33Q3ULW6 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc33Q3ULW6 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc33Q3ULW6 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc33Q3ULW6 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc33Q3ULW6 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc33Q3ULW6 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc33Q3ULW6 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc33Q3ULW6 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc33Q3ULW6 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc33Q3ULW6 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc33Q3ULW6 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc33Q3ULW6 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc33Q3ULW6 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc33Q3ULW6 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc33Q3ULW6 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc33Q3ULW6 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc33Q3ULW6 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc33Q3ULW6 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc33Q3ULW6 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc33Q3ULW6 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc33Q3ULW6 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc33Q3ULW6 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc33Q3ULW6 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc33Q3ULW6 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc33Q3ULW6 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc33Q3ULW6 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc33Q3ULW6 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc33Q3ULW6 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc33Q3ULW6 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc33Q3ULW6 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc33Q3ULW6 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc33Q3ULW6 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc33Q3ULW6 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccdc33Q3ULW6 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccdc33Q3ULW6 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccdc33Q3ULW6 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccdc33Q3ULW6 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccdc33Q3ULW6 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc33Q3ULW6 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc33Q3ULW6 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc33Q3ULW6 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc33Q3ULW6 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc33Q3ULW6 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc33Q3ULW6 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc33Q3ULW6 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc33Q3ULW6 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc33Q3ULW6 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc33Q3ULW6 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc33Q3ULW6 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc33Q3ULW6 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc33Q3ULW6 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc33Q3ULW6 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc33Q3ULW6 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc33Q3ULW6 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc33Q3ULW6 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc33Q3ULW6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms