Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHC0

Tnrc6c, Trinucleotide repeat-containing gene 6C protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnrc6cQ3UHC0 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Tnrc6cQ3UHC0 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Tnrc6cQ3UHC0 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Tnrc6cQ3UHC0 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Tnrc6cQ3UHC0 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Tnrc6cQ3UHC0 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Tnrc6cQ3UHC0 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Tnrc6cQ3UHC0 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Tnrc6cQ3UHC0 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Tnrc6cQ3UHC0 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Tnrc6cQ3UHC0 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Tnrc6cQ3UHC0 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Tnrc6cQ3UHC0 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Tnrc6cQ3UHC0 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Tnrc6cQ3UHC0 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Tnrc6cQ3UHC0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Tnrc6cQ3UHC0 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Tnrc6cQ3UHC0 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Tnrc6cQ3UHC0 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Tnrc6cQ3UHC0 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
Tnrc6cQ3UHC0 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Tnrc6cQ3UHC0 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Tnrc6cQ3UHC0 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Tnrc6cQ3UHC0 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Tnrc6cQ3UHC0 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Tnrc6cQ3UHC0 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Tnrc6cQ3UHC0 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Tnrc6cQ3UHC0 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Tnrc6cQ3UHC0 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Tnrc6cQ3UHC0 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Tnrc6cQ3UHC0 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Tnrc6cQ3UHC0 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Tnrc6cQ3UHC0 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Tnrc6cQ3UHC0 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Tnrc6cQ3UHC0 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Tnrc6cQ3UHC0 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Tnrc6cQ3UHC0 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Tnrc6cQ3UHC0 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Tnrc6cQ3UHC0 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Tnrc6cQ3UHC0 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Tnrc6cQ3UHC0 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Tnrc6cQ3UHC0 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Tnrc6cQ3UHC0 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Tnrc6cQ3UHC0 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Tnrc6cQ3UHC0 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Tnrc6cQ3UHC0 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Tnrc6cQ3UHC0 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Tnrc6cQ3UHC0 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Tnrc6cQ3UHC0 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Tnrc6cQ3UHC0 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Tnrc6cQ3UHC0 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Tnrc6cQ3UHC0 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Tnrc6cQ3UHC0 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Tnrc6cQ3UHC0 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Tnrc6cQ3UHC0 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Tnrc6cQ3UHC0 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Tnrc6cQ3UHC0 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Tnrc6cQ3UHC0 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Tnrc6cQ3UHC0 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Tnrc6cQ3UHC0 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Tnrc6cQ3UHC0 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Tnrc6cQ3UHC0 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Tnrc6cQ3UHC0 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Tnrc6cQ3UHC0 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Tnrc6cQ3UHC0 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Tnrc6cQ3UHC0 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Tnrc6cQ3UHC0 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Tnrc6cQ3UHC0 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Tnrc6cQ3UHC0 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Tnrc6cQ3UHC0 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Tnrc6cQ3UHC0 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Tnrc6cQ3UHC0 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Tnrc6cQ3UHC0 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Tnrc6cQ3UHC0 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Tnrc6cQ3UHC0 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Tnrc6cQ3UHC0 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Tnrc6cQ3UHC0 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Tnrc6cQ3UHC0 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Tnrc6cQ3UHC0 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Tnrc6cQ3UHC0 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Tnrc6cQ3UHC0 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Tnrc6cQ3UHC0 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Tnrc6cQ3UHC0 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Tnrc6cQ3UHC0 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Tnrc6cQ3UHC0 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Tnrc6cQ3UHC0 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Tnrc6cQ3UHC0 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Tnrc6cQ3UHC0 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Tnrc6cQ3UHC0 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Tnrc6cQ3UHC0 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Tnrc6cQ3UHC0 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Tnrc6cQ3UHC0 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Tnrc6cQ3UHC0 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Tnrc6cQ3UHC0 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Tnrc6cQ3UHC0 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Tnrc6cQ3UHC0 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Tnrc6cQ3UHC0 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Tnrc6cQ3UHC0 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Tnrc6cQ3UHC0 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Tnrc6cQ3UHC0 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms