Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFQ8

Carmil3, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carmil3Q3UFQ8 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Carmil3Q3UFQ8 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Carmil3Q3UFQ8 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Carmil3Q3UFQ8 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Carmil3Q3UFQ8 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Carmil3Q3UFQ8 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Carmil3Q3UFQ8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Carmil3Q3UFQ8 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Carmil3Q3UFQ8 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Carmil3Q3UFQ8 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Carmil3Q3UFQ8 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Carmil3Q3UFQ8 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Carmil3Q3UFQ8 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Carmil3Q3UFQ8 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Carmil3Q3UFQ8 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Carmil3Q3UFQ8 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Carmil3Q3UFQ8 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Carmil3Q3UFQ8 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Carmil3Q3UFQ8 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Carmil3Q3UFQ8 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Carmil3Q3UFQ8 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Carmil3Q3UFQ8 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Carmil3Q3UFQ8 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Carmil3Q3UFQ8 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Carmil3Q3UFQ8 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Carmil3Q3UFQ8 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Carmil3Q3UFQ8 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Carmil3Q3UFQ8 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Carmil3Q3UFQ8 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Carmil3Q3UFQ8 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Carmil3Q3UFQ8 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Carmil3Q3UFQ8 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Carmil3Q3UFQ8 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Carmil3Q3UFQ8 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Carmil3Q3UFQ8 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Carmil3Q3UFQ8 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Carmil3Q3UFQ8 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Carmil3Q3UFQ8 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Carmil3Q3UFQ8 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Carmil3Q3UFQ8 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Carmil3Q3UFQ8 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Carmil3Q3UFQ8 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Carmil3Q3UFQ8 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Carmil3Q3UFQ8 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Carmil3Q3UFQ8 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Carmil3Q3UFQ8 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Carmil3Q3UFQ8 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Carmil3Q3UFQ8 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Carmil3Q3UFQ8 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Carmil3Q3UFQ8 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Carmil3Q3UFQ8 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Carmil3Q3UFQ8 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Carmil3Q3UFQ8 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Carmil3Q3UFQ8 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Carmil3Q3UFQ8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Carmil3Q3UFQ8 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Carmil3Q3UFQ8 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Carmil3Q3UFQ8 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Carmil3Q3UFQ8 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Carmil3Q3UFQ8 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Carmil3Q3UFQ8 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Carmil3Q3UFQ8 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Carmil3Q3UFQ8 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Carmil3Q3UFQ8 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Carmil3Q3UFQ8 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Carmil3Q3UFQ8 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Carmil3Q3UFQ8 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Carmil3Q3UFQ8 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Carmil3Q3UFQ8 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Carmil3Q3UFQ8 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Carmil3Q3UFQ8 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Carmil3Q3UFQ8 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Carmil3Q3UFQ8 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Carmil3Q3UFQ8 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Carmil3Q3UFQ8 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Carmil3Q3UFQ8 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Carmil3Q3UFQ8 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Carmil3Q3UFQ8 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Carmil3Q3UFQ8 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Carmil3Q3UFQ8 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Carmil3Q3UFQ8 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Carmil3Q3UFQ8 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Carmil3Q3UFQ8 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Carmil3Q3UFQ8 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Carmil3Q3UFQ8 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Carmil3Q3UFQ8 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Carmil3Q3UFQ8 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Carmil3Q3UFQ8 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Carmil3Q3UFQ8 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Carmil3Q3UFQ8 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Carmil3Q3UFQ8 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Carmil3Q3UFQ8 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Carmil3Q3UFQ8 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Carmil3Q3UFQ8 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Carmil3Q3UFQ8 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Carmil3Q3UFQ8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Carmil3Q3UFQ8 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Carmil3Q3UFQ8 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Carmil3Q3UFQ8 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Carmil3Q3UFQ8 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms