Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1N2

Srebf2, Sterol regulatory element-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srebf2Q3U1N2 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Srebf2Q3U1N2 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Srebf2Q3U1N2 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Srebf2Q3U1N2 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Srebf2Q3U1N2 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Srebf2Q3U1N2 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Srebf2Q3U1N2 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Srebf2Q3U1N2 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Srebf2Q3U1N2 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Srebf2Q3U1N2 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Srebf2Q3U1N2 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Srebf2Q3U1N2 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Srebf2Q3U1N2 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Srebf2Q3U1N2 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Srebf2Q3U1N2 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Srebf2Q3U1N2 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Srebf2Q3U1N2 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Srebf2Q3U1N2 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Srebf2Q3U1N2 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Srebf2Q3U1N2 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Srebf2Q3U1N2 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Srebf2Q3U1N2 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Srebf2Q3U1N2 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Srebf2Q3U1N2 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Srebf2Q3U1N2 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Srebf2Q3U1N2 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Srebf2Q3U1N2 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Srebf2Q3U1N2 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Srebf2Q3U1N2 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Srebf2Q3U1N2 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Srebf2Q3U1N2 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Srebf2Q3U1N2 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Srebf2Q3U1N2 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Srebf2Q3U1N2 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Srebf2Q3U1N2 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Srebf2Q3U1N2 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Srebf2Q3U1N2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Srebf2Q3U1N2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Srebf2Q3U1N2 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Srebf2Q3U1N2 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Srebf2Q3U1N2 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Srebf2Q3U1N2 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Srebf2Q3U1N2 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Srebf2Q3U1N2 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Srebf2Q3U1N2 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Srebf2Q3U1N2 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Srebf2Q3U1N2 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Srebf2Q3U1N2 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Srebf2Q3U1N2 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Srebf2Q3U1N2 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Srebf2Q3U1N2 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Srebf2Q3U1N2 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Srebf2Q3U1N2 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Srebf2Q3U1N2 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Srebf2Q3U1N2 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Srebf2Q3U1N2 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Srebf2Q3U1N2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Srebf2Q3U1N2 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Srebf2Q3U1N2 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Srebf2Q3U1N2 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Srebf2Q3U1N2 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Srebf2Q3U1N2 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Srebf2Q3U1N2 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Srebf2Q3U1N2 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Srebf2Q3U1N2 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Srebf2Q3U1N2 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Srebf2Q3U1N2 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Srebf2Q3U1N2 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Srebf2Q3U1N2 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Srebf2Q3U1N2 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Srebf2Q3U1N2 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Srebf2Q3U1N2 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Srebf2Q3U1N2 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Srebf2Q3U1N2 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Srebf2Q3U1N2 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Srebf2Q3U1N2 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Srebf2Q3U1N2 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Srebf2Q3U1N2 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Srebf2Q3U1N2 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Srebf2Q3U1N2 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Srebf2Q3U1N2 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Srebf2Q3U1N2 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Srebf2Q3U1N2 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Srebf2Q3U1N2 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Srebf2Q3U1N2 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Srebf2Q3U1N2 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Srebf2Q3U1N2 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Srebf2Q3U1N2 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Srebf2Q3U1N2 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Srebf2Q3U1N2 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Srebf2Q3U1N2 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Srebf2Q3U1N2 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Srebf2Q3U1N2 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Srebf2Q3U1N2 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Srebf2Q3U1N2 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Srebf2Q3U1N2 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Srebf2Q3U1N2 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Srebf2Q3U1N2 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Srebf2Q3U1N2 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Srebf2Q3U1N2 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.4 ms