Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0V1

Khsrp, Far upstream element-binding protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 748 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KhsrpQ3U0V1 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KhsrpQ3U0V1 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KhsrpQ3U0V1 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KhsrpQ3U0V1 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KhsrpQ3U0V1 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KhsrpQ3U0V1 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KhsrpQ3U0V1 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KhsrpQ3U0V1 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KhsrpQ3U0V1 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KhsrpQ3U0V1 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KhsrpQ3U0V1 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.35
KhsrpQ3U0V1 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
KhsrpQ3U0V1 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KhsrpQ3U0V1 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KhsrpQ3U0V1 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
KhsrpQ3U0V1 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KhsrpQ3U0V1 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KhsrpQ3U0V1 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KhsrpQ3U0V1 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KhsrpQ3U0V1 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KhsrpQ3U0V1 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KhsrpQ3U0V1 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KhsrpQ3U0V1 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KhsrpQ3U0V1 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
KhsrpQ3U0V1 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KhsrpQ3U0V1 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KhsrpQ3U0V1 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KhsrpQ3U0V1 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KhsrpQ3U0V1 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KhsrpQ3U0V1 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KhsrpQ3U0V1 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KhsrpQ3U0V1 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
KhsrpQ3U0V1 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KhsrpQ3U0V1 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KhsrpQ3U0V1 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KhsrpQ3U0V1 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KhsrpQ3U0V1 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KhsrpQ3U0V1 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KhsrpQ3U0V1 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KhsrpQ3U0V1 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KhsrpQ3U0V1 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KhsrpQ3U0V1 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KhsrpQ3U0V1 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KhsrpQ3U0V1 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KhsrpQ3U0V1 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KhsrpQ3U0V1 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KhsrpQ3U0V1 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KhsrpQ3U0V1 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KhsrpQ3U0V1 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KhsrpQ3U0V1 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
KhsrpQ3U0V1 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
KhsrpQ3U0V1 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KhsrpQ3U0V1 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KhsrpQ3U0V1 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KhsrpQ3U0V1 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
KhsrpQ3U0V1 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KhsrpQ3U0V1 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KhsrpQ3U0V1 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KhsrpQ3U0V1 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KhsrpQ3U0V1 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KhsrpQ3U0V1 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KhsrpQ3U0V1 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KhsrpQ3U0V1 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KhsrpQ3U0V1 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KhsrpQ3U0V1 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KhsrpQ3U0V1 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KhsrpQ3U0V1 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KhsrpQ3U0V1 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KhsrpQ3U0V1 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KhsrpQ3U0V1 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KhsrpQ3U0V1 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KhsrpQ3U0V1 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KhsrpQ3U0V1 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KhsrpQ3U0V1 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KhsrpQ3U0V1 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KhsrpQ3U0V1 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KhsrpQ3U0V1 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KhsrpQ3U0V1 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KhsrpQ3U0V1 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KhsrpQ3U0V1 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KhsrpQ3U0V1 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
KhsrpQ3U0V1 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
KhsrpQ3U0V1 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KhsrpQ3U0V1 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KhsrpQ3U0V1 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KhsrpQ3U0V1 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KhsrpQ3U0V1 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KhsrpQ3U0V1 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KhsrpQ3U0V1 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KhsrpQ3U0V1 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KhsrpQ3U0V1 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KhsrpQ3U0V1 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KhsrpQ3U0V1 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KhsrpQ3U0V1 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KhsrpQ3U0V1 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KhsrpQ3U0V1 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KhsrpQ3U0V1 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KhsrpQ3U0V1 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KhsrpQ3U0V1 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KhsrpQ3U0V1 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
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