Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYV2

Hhla1, HERV-H LTR-associating protein 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hhla1Q3TYV2 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hhla1Q3TYV2 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hhla1Q3TYV2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hhla1Q3TYV2 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hhla1Q3TYV2 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hhla1Q3TYV2 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hhla1Q3TYV2 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hhla1Q3TYV2 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hhla1Q3TYV2 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hhla1Q3TYV2 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hhla1Q3TYV2 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hhla1Q3TYV2 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hhla1Q3TYV2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hhla1Q3TYV2 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hhla1Q3TYV2 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hhla1Q3TYV2 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hhla1Q3TYV2 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hhla1Q3TYV2 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Hhla1Q3TYV2 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hhla1Q3TYV2 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hhla1Q3TYV2 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hhla1Q3TYV2 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hhla1Q3TYV2 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hhla1Q3TYV2 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hhla1Q3TYV2 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hhla1Q3TYV2 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hhla1Q3TYV2 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hhla1Q3TYV2 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Hhla1Q3TYV2 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hhla1Q3TYV2 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hhla1Q3TYV2 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hhla1Q3TYV2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hhla1Q3TYV2 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hhla1Q3TYV2 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hhla1Q3TYV2 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hhla1Q3TYV2 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hhla1Q3TYV2 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hhla1Q3TYV2 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Hhla1Q3TYV2 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hhla1Q3TYV2 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Hhla1Q3TYV2 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Hhla1Q3TYV2 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hhla1Q3TYV2 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hhla1Q3TYV2 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Hhla1Q3TYV2 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Hhla1Q3TYV2 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hhla1Q3TYV2 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hhla1Q3TYV2 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Hhla1Q3TYV2 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hhla1Q3TYV2 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Hhla1Q3TYV2 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hhla1Q3TYV2 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hhla1Q3TYV2 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hhla1Q3TYV2 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hhla1Q3TYV2 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hhla1Q3TYV2 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hhla1Q3TYV2 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hhla1Q3TYV2 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hhla1Q3TYV2 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Hhla1Q3TYV2 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hhla1Q3TYV2 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hhla1Q3TYV2 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hhla1Q3TYV2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hhla1Q3TYV2 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hhla1Q3TYV2 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hhla1Q3TYV2 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hhla1Q3TYV2 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hhla1Q3TYV2 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hhla1Q3TYV2 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hhla1Q3TYV2 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hhla1Q3TYV2 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hhla1Q3TYV2 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hhla1Q3TYV2 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hhla1Q3TYV2 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hhla1Q3TYV2 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hhla1Q3TYV2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hhla1Q3TYV2 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hhla1Q3TYV2 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hhla1Q3TYV2 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hhla1Q3TYV2 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hhla1Q3TYV2 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hhla1Q3TYV2 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hhla1Q3TYV2 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hhla1Q3TYV2 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hhla1Q3TYV2 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hhla1Q3TYV2 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hhla1Q3TYV2 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hhla1Q3TYV2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hhla1Q3TYV2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hhla1Q3TYV2 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hhla1Q3TYV2 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hhla1Q3TYV2 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hhla1Q3TYV2 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Hhla1Q3TYV2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hhla1Q3TYV2 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hhla1Q3TYV2 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hhla1Q3TYV2 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hhla1Q3TYV2 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hhla1Q3TYV2 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hhla1Q3TYV2 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms