Protein–RNA interactions for Protein: Q3LHN0

KRTAP25-1, Keratin-associated protein 25-1, humanhuman

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Length 102 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP25-1Q3LHN0 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
KRTAP25-1Q3LHN0 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
KRTAP25-1Q3LHN0 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
KRTAP25-1Q3LHN0 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
KRTAP25-1Q3LHN0 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
KRTAP25-1Q3LHN0 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
KRTAP25-1Q3LHN0 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
KRTAP25-1Q3LHN0 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
KRTAP25-1Q3LHN0 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
KRTAP25-1Q3LHN0 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
KRTAP25-1Q3LHN0 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
KRTAP25-1Q3LHN0 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
KRTAP25-1Q3LHN0 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
KRTAP25-1Q3LHN0 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
KRTAP25-1Q3LHN0 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
KRTAP25-1Q3LHN0 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
KRTAP25-1Q3LHN0 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
KRTAP25-1Q3LHN0 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
KRTAP25-1Q3LHN0 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
KRTAP25-1Q3LHN0 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
KRTAP25-1Q3LHN0 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
KRTAP25-1Q3LHN0 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
KRTAP25-1Q3LHN0 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
KRTAP25-1Q3LHN0 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
KRTAP25-1Q3LHN0 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
KRTAP25-1Q3LHN0 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
KRTAP25-1Q3LHN0 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
KRTAP25-1Q3LHN0 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
KRTAP25-1Q3LHN0 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
KRTAP25-1Q3LHN0 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
KRTAP25-1Q3LHN0 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
KRTAP25-1Q3LHN0 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
KRTAP25-1Q3LHN0 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
KRTAP25-1Q3LHN0 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
KRTAP25-1Q3LHN0 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
KRTAP25-1Q3LHN0 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
KRTAP25-1Q3LHN0 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
KRTAP25-1Q3LHN0 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
KRTAP25-1Q3LHN0 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
KRTAP25-1Q3LHN0 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
KRTAP25-1Q3LHN0 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
KRTAP25-1Q3LHN0 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
KRTAP25-1Q3LHN0 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
KRTAP25-1Q3LHN0 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
KRTAP25-1Q3LHN0 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
KRTAP25-1Q3LHN0 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
KRTAP25-1Q3LHN0 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
KRTAP25-1Q3LHN0 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
KRTAP25-1Q3LHN0 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
KRTAP25-1Q3LHN0 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
KRTAP25-1Q3LHN0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
KRTAP25-1Q3LHN0 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
KRTAP25-1Q3LHN0 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
KRTAP25-1Q3LHN0 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
KRTAP25-1Q3LHN0 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
KRTAP25-1Q3LHN0 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
KRTAP25-1Q3LHN0 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
KRTAP25-1Q3LHN0 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
KRTAP25-1Q3LHN0 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
KRTAP25-1Q3LHN0 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
KRTAP25-1Q3LHN0 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
KRTAP25-1Q3LHN0 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
KRTAP25-1Q3LHN0 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
KRTAP25-1Q3LHN0 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
KRTAP25-1Q3LHN0 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
KRTAP25-1Q3LHN0 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
KRTAP25-1Q3LHN0 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
KRTAP25-1Q3LHN0 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
KRTAP25-1Q3LHN0 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
KRTAP25-1Q3LHN0 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
KRTAP25-1Q3LHN0 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
KRTAP25-1Q3LHN0 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
KRTAP25-1Q3LHN0 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
KRTAP25-1Q3LHN0 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
KRTAP25-1Q3LHN0 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
KRTAP25-1Q3LHN0 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
KRTAP25-1Q3LHN0 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
KRTAP25-1Q3LHN0 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
KRTAP25-1Q3LHN0 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
KRTAP25-1Q3LHN0 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
KRTAP25-1Q3LHN0 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
KRTAP25-1Q3LHN0 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
KRTAP25-1Q3LHN0 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
KRTAP25-1Q3LHN0 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
KRTAP25-1Q3LHN0 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
KRTAP25-1Q3LHN0 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
KRTAP25-1Q3LHN0 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
KRTAP25-1Q3LHN0 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
KRTAP25-1Q3LHN0 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
KRTAP25-1Q3LHN0 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
KRTAP25-1Q3LHN0 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
KRTAP25-1Q3LHN0 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
KRTAP25-1Q3LHN0 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
KRTAP25-1Q3LHN0 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
KRTAP25-1Q3LHN0 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
KRTAP25-1Q3LHN0 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
KRTAP25-1Q3LHN0 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
KRTAP25-1Q3LHN0 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
KRTAP25-1Q3LHN0 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
KRTAP25-1Q3LHN0 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
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