Protein–RNA interactions for Protein: Q2QD12

RPEL1, Ribulose-phosphate 3-epimerase-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPEL1Q2QD12 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPEL1Q2QD12 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPEL1Q2QD12 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPEL1Q2QD12 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RPEL1Q2QD12 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPEL1Q2QD12 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPEL1Q2QD12 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPEL1Q2QD12 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPEL1Q2QD12 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPEL1Q2QD12 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RPEL1Q2QD12 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPEL1Q2QD12 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPEL1Q2QD12 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPEL1Q2QD12 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RPEL1Q2QD12 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPEL1Q2QD12 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPEL1Q2QD12 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPEL1Q2QD12 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPEL1Q2QD12 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPEL1Q2QD12 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPEL1Q2QD12 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RPEL1Q2QD12 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPEL1Q2QD12 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPEL1Q2QD12 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPEL1Q2QD12 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPEL1Q2QD12 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPEL1Q2QD12 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPEL1Q2QD12 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPEL1Q2QD12 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RPEL1Q2QD12 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPEL1Q2QD12 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RPEL1Q2QD12 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RPEL1Q2QD12 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPEL1Q2QD12 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPEL1Q2QD12 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPEL1Q2QD12 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPEL1Q2QD12 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPEL1Q2QD12 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPEL1Q2QD12 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPEL1Q2QD12 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPEL1Q2QD12 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPEL1Q2QD12 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPEL1Q2QD12 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPEL1Q2QD12 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPEL1Q2QD12 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPEL1Q2QD12 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPEL1Q2QD12 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RPEL1Q2QD12 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPEL1Q2QD12 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPEL1Q2QD12 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RPEL1Q2QD12 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPEL1Q2QD12 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPEL1Q2QD12 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPEL1Q2QD12 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPEL1Q2QD12 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPEL1Q2QD12 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPEL1Q2QD12 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPEL1Q2QD12 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPEL1Q2QD12 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPEL1Q2QD12 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPEL1Q2QD12 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RPEL1Q2QD12 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPEL1Q2QD12 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPEL1Q2QD12 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPEL1Q2QD12 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPEL1Q2QD12 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPEL1Q2QD12 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPEL1Q2QD12 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPEL1Q2QD12 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPEL1Q2QD12 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPEL1Q2QD12 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPEL1Q2QD12 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPEL1Q2QD12 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPEL1Q2QD12 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPEL1Q2QD12 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPEL1Q2QD12 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPEL1Q2QD12 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPEL1Q2QD12 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPEL1Q2QD12 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPEL1Q2QD12 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
RPEL1Q2QD12 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPEL1Q2QD12 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPEL1Q2QD12 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPEL1Q2QD12 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPEL1Q2QD12 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPEL1Q2QD12 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPEL1Q2QD12 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPEL1Q2QD12 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPEL1Q2QD12 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPEL1Q2QD12 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
RPEL1Q2QD12 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPEL1Q2QD12 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPEL1Q2QD12 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPEL1Q2QD12 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPEL1Q2QD12 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPEL1Q2QD12 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPEL1Q2QD12 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPEL1Q2QD12 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPEL1Q2QD12 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPEL1Q2QD12 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.1 ms