Protein–RNA interactions for Protein: Q2KN98

Specc1l, Cytospin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Specc1lQ2KN98 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Specc1lQ2KN98 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Specc1lQ2KN98 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Specc1lQ2KN98 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Specc1lQ2KN98 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Specc1lQ2KN98 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Specc1lQ2KN98 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Specc1lQ2KN98 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Specc1lQ2KN98 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Specc1lQ2KN98 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Specc1lQ2KN98 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Specc1lQ2KN98 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Specc1lQ2KN98 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Specc1lQ2KN98 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Specc1lQ2KN98 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Specc1lQ2KN98 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Specc1lQ2KN98 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Specc1lQ2KN98 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Specc1lQ2KN98 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Specc1lQ2KN98 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Specc1lQ2KN98 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Specc1lQ2KN98 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Specc1lQ2KN98 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Specc1lQ2KN98 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Specc1lQ2KN98 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Specc1lQ2KN98 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Specc1lQ2KN98 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Specc1lQ2KN98 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Specc1lQ2KN98 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Specc1lQ2KN98 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Specc1lQ2KN98 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Specc1lQ2KN98 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Specc1lQ2KN98 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Specc1lQ2KN98 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Specc1lQ2KN98 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Specc1lQ2KN98 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Specc1lQ2KN98 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Specc1lQ2KN98 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Specc1lQ2KN98 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Specc1lQ2KN98 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Specc1lQ2KN98 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Specc1lQ2KN98 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Specc1lQ2KN98 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Specc1lQ2KN98 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Specc1lQ2KN98 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Specc1lQ2KN98 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Specc1lQ2KN98 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Specc1lQ2KN98 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Specc1lQ2KN98 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Specc1lQ2KN98 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Specc1lQ2KN98 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Specc1lQ2KN98 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Specc1lQ2KN98 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Specc1lQ2KN98 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Specc1lQ2KN98 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Specc1lQ2KN98 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Specc1lQ2KN98 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Specc1lQ2KN98 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Specc1lQ2KN98 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Specc1lQ2KN98 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Specc1lQ2KN98 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Specc1lQ2KN98 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Specc1lQ2KN98 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Specc1lQ2KN98 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Specc1lQ2KN98 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Specc1lQ2KN98 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Specc1lQ2KN98 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Specc1lQ2KN98 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Specc1lQ2KN98 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Specc1lQ2KN98 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Specc1lQ2KN98 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Specc1lQ2KN98 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Specc1lQ2KN98 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Specc1lQ2KN98 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Specc1lQ2KN98 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Specc1lQ2KN98 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Specc1lQ2KN98 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Specc1lQ2KN98 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Specc1lQ2KN98 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Specc1lQ2KN98 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Specc1lQ2KN98 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Specc1lQ2KN98 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Specc1lQ2KN98 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Specc1lQ2KN98 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Specc1lQ2KN98 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Specc1lQ2KN98 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Specc1lQ2KN98 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Specc1lQ2KN98 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Specc1lQ2KN98 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Specc1lQ2KN98 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Specc1lQ2KN98 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Specc1lQ2KN98 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Specc1lQ2KN98 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Specc1lQ2KN98 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Specc1lQ2KN98 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Specc1lQ2KN98 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Specc1lQ2KN98 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Specc1lQ2KN98 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Specc1lQ2KN98 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Specc1lQ2KN98 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms