Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FXNQ16595 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FXNQ16595 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FXNQ16595 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FXNQ16595 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FXNQ16595 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FXNQ16595 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FXNQ16595 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FXNQ16595 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FXNQ16595 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FXNQ16595 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FXNQ16595 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FXNQ16595 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FXNQ16595 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FXNQ16595 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
FXNQ16595 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FXNQ16595 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FXNQ16595 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FXNQ16595 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FXNQ16595 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FXNQ16595 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FXNQ16595 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FXNQ16595 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FXNQ16595 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
FXNQ16595 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FXNQ16595 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FXNQ16595 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FXNQ16595 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FXNQ16595 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FXNQ16595 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FXNQ16595 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FXNQ16595 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FXNQ16595 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FXNQ16595 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FXNQ16595 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FXNQ16595 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FXNQ16595 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FXNQ16595 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FXNQ16595 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FXNQ16595 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FXNQ16595 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FXNQ16595 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FXNQ16595 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FXNQ16595 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FXNQ16595 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
FXNQ16595 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
FXNQ16595 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FXNQ16595 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FXNQ16595 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FXNQ16595 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FXNQ16595 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FXNQ16595 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FXNQ16595 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
FXNQ16595 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FXNQ16595 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FXNQ16595 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FXNQ16595 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FXNQ16595 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FXNQ16595 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FXNQ16595 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FXNQ16595 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FXNQ16595 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FXNQ16595 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FXNQ16595 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FXNQ16595 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FXNQ16595 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FXNQ16595 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FXNQ16595 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FXNQ16595 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FXNQ16595 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FXNQ16595 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FXNQ16595 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FXNQ16595 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FXNQ16595 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FXNQ16595 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FXNQ16595 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FXNQ16595 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FXNQ16595 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FXNQ16595 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FXNQ16595 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FXNQ16595 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FXNQ16595 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FXNQ16595 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FXNQ16595 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FXNQ16595 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FXNQ16595 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FXNQ16595 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FXNQ16595 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FXNQ16595 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FXNQ16595 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
FXNQ16595 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FXNQ16595 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FXNQ16595 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FXNQ16595 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
FXNQ16595 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
FXNQ16595 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
FXNQ16595 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
FXNQ16595 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
FXNQ16595 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FXNQ16595 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.2 ms