Protein–RNA interactions for Protein: Q15811

ITSN1, Intersectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,721 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITSN1Q15811 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
ITSN1Q15811 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
ITSN1Q15811 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
ITSN1Q15811 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
ITSN1Q15811 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
ITSN1Q15811 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
ITSN1Q15811 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
ITSN1Q15811 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
ITSN1Q15811 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
ITSN1Q15811 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
ITSN1Q15811 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
ITSN1Q15811 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
ITSN1Q15811 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
ITSN1Q15811 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
ITSN1Q15811 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
ITSN1Q15811 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
ITSN1Q15811 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
ITSN1Q15811 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
ITSN1Q15811 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
ITSN1Q15811 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
ITSN1Q15811 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
ITSN1Q15811 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
ITSN1Q15811 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
ITSN1Q15811 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
ITSN1Q15811 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
ITSN1Q15811 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
ITSN1Q15811 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
ITSN1Q15811 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC32.32■■■□□ 2.76
ITSN1Q15811 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
ITSN1Q15811 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
ITSN1Q15811 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
ITSN1Q15811 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
ITSN1Q15811 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
ITSN1Q15811 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
ITSN1Q15811 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
ITSN1Q15811 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
ITSN1Q15811 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
ITSN1Q15811 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
ITSN1Q15811 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.3■■■□□ 2.76
ITSN1Q15811 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
ITSN1Q15811 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
ITSN1Q15811 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
ITSN1Q15811 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
ITSN1Q15811 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC32.29■■■□□ 2.76
ITSN1Q15811 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
ITSN1Q15811 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
ITSN1Q15811 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
ITSN1Q15811 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
ITSN1Q15811 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
ITSN1Q15811 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
ITSN1Q15811 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
ITSN1Q15811 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
ITSN1Q15811 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
ITSN1Q15811 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
ITSN1Q15811 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
ITSN1Q15811 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
ITSN1Q15811 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
ITSN1Q15811 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC32.26■■■□□ 2.76
ITSN1Q15811 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.76
ITSN1Q15811 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.76
ITSN1Q15811 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
ITSN1Q15811 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
ITSN1Q15811 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
ITSN1Q15811 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
ITSN1Q15811 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
ITSN1Q15811 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
ITSN1Q15811 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
ITSN1Q15811 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
ITSN1Q15811 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
ITSN1Q15811 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
ITSN1Q15811 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.23■■■□□ 2.75
ITSN1Q15811 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
ITSN1Q15811 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
ITSN1Q15811 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
ITSN1Q15811 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
ITSN1Q15811 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
ITSN1Q15811 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
ITSN1Q15811 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
ITSN1Q15811 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.74
ITSN1Q15811 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
ITSN1Q15811 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
ITSN1Q15811 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
ITSN1Q15811 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
ITSN1Q15811 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
ITSN1Q15811 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
ITSN1Q15811 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
ITSN1Q15811 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
ITSN1Q15811 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
ITSN1Q15811 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
ITSN1Q15811 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
ITSN1Q15811 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
ITSN1Q15811 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
ITSN1Q15811 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
ITSN1Q15811 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
ITSN1Q15811 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
ITSN1Q15811 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC32.17■■■□□ 2.74
ITSN1Q15811 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
ITSN1Q15811 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
ITSN1Q15811 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
ITSN1Q15811 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.16■■■□□ 2.74
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