Protein–RNA interactions for Protein: Q15653

NFKBIB, NF-kappa-B inhibitor beta, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIBQ15653 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
NFKBIBQ15653 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NFKBIBQ15653 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NFKBIBQ15653 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NFKBIBQ15653 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
NFKBIBQ15653 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NFKBIBQ15653 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NFKBIBQ15653 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NFKBIBQ15653 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
NFKBIBQ15653 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
NFKBIBQ15653 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
NFKBIBQ15653 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NFKBIBQ15653 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
NFKBIBQ15653 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NFKBIBQ15653 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NFKBIBQ15653 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NFKBIBQ15653 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NFKBIBQ15653 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NFKBIBQ15653 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NFKBIBQ15653 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NFKBIBQ15653 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
NFKBIBQ15653 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
NFKBIBQ15653 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NFKBIBQ15653 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NFKBIBQ15653 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
NFKBIBQ15653 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
NFKBIBQ15653 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
NFKBIBQ15653 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NFKBIBQ15653 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
NFKBIBQ15653 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NFKBIBQ15653 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NFKBIBQ15653 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NFKBIBQ15653 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NFKBIBQ15653 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NFKBIBQ15653 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NFKBIBQ15653 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC27.52■■■□□ 2
NFKBIBQ15653 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
NFKBIBQ15653 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NFKBIBQ15653 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NFKBIBQ15653 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NFKBIBQ15653 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NFKBIBQ15653 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NFKBIBQ15653 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NFKBIBQ15653 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NFKBIBQ15653 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NFKBIBQ15653 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NFKBIBQ15653 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NFKBIBQ15653 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NFKBIBQ15653 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NFKBIBQ15653 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NFKBIBQ15653 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NFKBIBQ15653 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NFKBIBQ15653 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NFKBIBQ15653 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NFKBIBQ15653 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NFKBIBQ15653 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NFKBIBQ15653 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
NFKBIBQ15653 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NFKBIBQ15653 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NFKBIBQ15653 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NFKBIBQ15653 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NFKBIBQ15653 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NFKBIBQ15653 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NFKBIBQ15653 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NFKBIBQ15653 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NFKBIBQ15653 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NFKBIBQ15653 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NFKBIBQ15653 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NFKBIBQ15653 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NFKBIBQ15653 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NFKBIBQ15653 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NFKBIBQ15653 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NFKBIBQ15653 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NFKBIBQ15653 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
NFKBIBQ15653 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NFKBIBQ15653 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NFKBIBQ15653 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NFKBIBQ15653 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NFKBIBQ15653 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NFKBIBQ15653 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NFKBIBQ15653 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NFKBIBQ15653 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NFKBIBQ15653 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NFKBIBQ15653 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
NFKBIBQ15653 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NFKBIBQ15653 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NFKBIBQ15653 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NFKBIBQ15653 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NFKBIBQ15653 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NFKBIBQ15653 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NFKBIBQ15653 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NFKBIBQ15653 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NFKBIBQ15653 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NFKBIBQ15653 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NFKBIBQ15653 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NFKBIBQ15653 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NFKBIBQ15653 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NFKBIBQ15653 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
NFKBIBQ15653 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NFKBIBQ15653 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms