Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TAF1AQ15573 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TAF1AQ15573 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TAF1AQ15573 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TAF1AQ15573 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TAF1AQ15573 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TAF1AQ15573 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TAF1AQ15573 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TAF1AQ15573 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TAF1AQ15573 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TAF1AQ15573 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TAF1AQ15573 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TAF1AQ15573 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TAF1AQ15573 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TAF1AQ15573 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TAF1AQ15573 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TAF1AQ15573 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TAF1AQ15573 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TAF1AQ15573 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TAF1AQ15573 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TAF1AQ15573 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TAF1AQ15573 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TAF1AQ15573 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TAF1AQ15573 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TAF1AQ15573 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TAF1AQ15573 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TAF1AQ15573 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TAF1AQ15573 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TAF1AQ15573 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TAF1AQ15573 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TAF1AQ15573 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TAF1AQ15573 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TAF1AQ15573 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TAF1AQ15573 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TAF1AQ15573 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TAF1AQ15573 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TAF1AQ15573 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TAF1AQ15573 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TAF1AQ15573 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TAF1AQ15573 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TAF1AQ15573 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TAF1AQ15573 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TAF1AQ15573 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TAF1AQ15573 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TAF1AQ15573 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TAF1AQ15573 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TAF1AQ15573 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TAF1AQ15573 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TAF1AQ15573 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TAF1AQ15573 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TAF1AQ15573 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TAF1AQ15573 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TAF1AQ15573 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TAF1AQ15573 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TAF1AQ15573 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TAF1AQ15573 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TAF1AQ15573 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TAF1AQ15573 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TAF1AQ15573 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TAF1AQ15573 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TAF1AQ15573 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TAF1AQ15573 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TAF1AQ15573 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TAF1AQ15573 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TAF1AQ15573 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TAF1AQ15573 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TAF1AQ15573 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TAF1AQ15573 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
TAF1AQ15573 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TAF1AQ15573 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TAF1AQ15573 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TAF1AQ15573 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TAF1AQ15573 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TAF1AQ15573 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TAF1AQ15573 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TAF1AQ15573 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TAF1AQ15573 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TAF1AQ15573 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TAF1AQ15573 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TAF1AQ15573 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TAF1AQ15573 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TAF1AQ15573 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TAF1AQ15573 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TAF1AQ15573 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TAF1AQ15573 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TAF1AQ15573 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TAF1AQ15573 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TAF1AQ15573 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TAF1AQ15573 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TAF1AQ15573 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TAF1AQ15573 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TAF1AQ15573 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TAF1AQ15573 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TAF1AQ15573 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TAF1AQ15573 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TAF1AQ15573 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TAF1AQ15573 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TAF1AQ15573 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TAF1AQ15573 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TAF1AQ15573 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
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