Protein–RNA interactions for Protein: Q15365

PCBP1, Poly(rC)-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1Q15365 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.564e-7■■■■■ 34.9
PCBP1Q15365 STRN4-208ENST00000594581 2692 ntTSL 217.9■□□□□ 0.464e-7■■■■■ 34.9
PCBP1Q15365 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.424e-7■■■■■ 34.9
PCBP1Q15365 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.212e-6■■■■■ 34.9
PCBP1Q15365 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.95e-8■■■■■ 34.9
PCBP1Q15365 QPRT-201ENST00000219771 913 ntTSL 219.96■□□□□ 0.796e-8■■■■■ 34.9
PCBP1Q15365 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.576e-8■■■■■ 34.9
PCBP1Q15365 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.56e-8■■■■■ 34.9
PCBP1Q15365 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.26e-7■■■■■ 34.8
PCBP1Q15365 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.066e-7■■■■■ 34.8
PCBP1Q15365 ST3GAL3-225ENST00000489897 998 ntTSL 521.22■□□□□ 0.996e-7■■■■■ 34.8
PCBP1Q15365 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.966e-7■■■■■ 34.8
PCBP1Q15365 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.946e-7■■■■■ 34.8
PCBP1Q15365 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.916e-7■■■■■ 34.8
PCBP1Q15365 ST3GAL3-230ENST00000530154 1670 ntTSL 220.13■□□□□ 0.816e-7■■■■■ 34.8
PCBP1Q15365 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.636e-7■■■■■ 34.8
PCBP1Q15365 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.576e-7■■■■■ 34.8
PCBP1Q15365 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.146e-7■■■■■ 34.8
PCBP1Q15365 ST3GAL3-226ENST00000490502 592 ntTSL 315.48■□□□□ 0.076e-7■■■■■ 34.8
PCBP1Q15365 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.046e-7■■■■■ 34.8
PCBP1Q15365 ST3GAL3-202ENST00000330208 1479 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.136e-7■■■■■ 34.8
PCBP1Q15365 ST3GAL3-210ENST00000361746 1335 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.516e-7■■■■■ 34.8
PCBP1Q15365 ST3GAL3-217ENST00000372369 1038 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.586e-7■■■■■ 34.8
PCBP1Q15365 ST3GAL3-229ENST00000528371 599 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.616e-7■■■■■ 34.8
PCBP1Q15365 ST3GAL3-215ENST00000372367 644 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.616e-7■■■■■ 34.8
PCBP1Q15365 ST3GAL3-231ENST00000530581 893 ntTSL 1 (best)11.21□□□□□ -0.616e-7■■■■■ 34.8
PCBP1Q15365 ST3GAL3-203ENST00000332628 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.666e-7■■■■■ 34.8
PCBP1Q15365 ST3GAL3-216ENST00000372368 1290 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.76e-7■■■■■ 34.8
PCBP1Q15365 ST3GAL3-234ENST00000531993 786 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.716e-7■■■■■ 34.8
PCBP1Q15365 ST3GAL3-214ENST00000372366 670 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.756e-7■■■■■ 34.8
PCBP1Q15365 ST3GAL3-238ENST00000533997 1007 ntTSL 1 (best)10.32□□□□□ -0.766e-7■■■■■ 34.8
PCBP1Q15365 ST3GAL3-218ENST00000372372 1242 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.766e-7■■■■■ 34.8
PCBP1Q15365 ST3GAL3-236ENST00000533212 781 ntTSL 1 (best)10.11□□□□□ -0.796e-7■■■■■ 34.8
PCBP1Q15365 ST3GAL3-222ENST00000469715 1160 ntTSL 1 (best)10.11□□□□□ -0.796e-7■■■■■ 34.8
PCBP1Q15365 ST3GAL3-227ENST00000490541 976 ntTSL 1 (best)10.11□□□□□ -0.796e-7■■■■■ 34.8
PCBP1Q15365 ST3GAL3-211ENST00000361812 513 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.836e-7■■■■■ 34.8
PCBP1Q15365 ST3GAL3-237ENST00000533933 834 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.926e-7■■■■■ 34.8
PCBP1Q15365 ST3GAL3-213ENST00000372365 673 ntTSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.036e-7■■■■■ 34.8
PCBP1Q15365 ST3GAL3-221ENST00000461375 806 ntTSL 57.53□□□□□ -1.26e-7■■■■■ 34.8
PCBP1Q15365 ST3GAL3-212ENST00000372362 468 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.226e-7■■■■■ 34.8
PCBP1Q15365 ST3GAL3-232ENST00000531451 420 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.226e-7■■■■■ 34.8
PCBP1Q15365 ST3GAL3-233ENST00000531816 344 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.436e-7■■■■■ 34.8
PCBP1Q15365 PHF1-208ENST00000486845 1099 ntTSL 522.37■■□□□ 1.172e-6■■■■■ 34.8
PCBP1Q15365 RAD23A-202ENST00000586375 894 ntTSL 316.99■□□□□ 0.311e-10■■■■■ 34.7
PCBP1Q15365 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.174e-7■■■■■ 34.7
PCBP1Q15365 AC023509.3-202ENST00000591834 1609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.134e-7■■■■■ 34.7
PCBP1Q15365 ATF7-201ENST00000420353 6680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.834e-7■■■■■ 34.7
PCBP1Q15365 OGT-204ENST00000455587 632 ntTSL 39.46□□□□□ -0.92e-13■■■■■ 34.7
PCBP1Q15365 OGT-202ENST00000373719 5461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.252e-13■■■■■ 34.7
PCBP1Q15365 OGT-201ENST00000373701 3310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.42e-13■■■■■ 34.7
PCBP1Q15365 OGT-210ENST00000488174 7243 ntTSL 55.93□□□□□ -1.462e-13■■■■■ 34.7
PCBP1Q15365 TIMM44-208ENST00000598968 797 ntTSL 325.04■■□□□ 1.63e-11■■■■■ 34.6
PCBP1Q15365 CUTA-208ENST00000482684 837 ntTSL 1 (best)22.57■■□□□ 1.23e-7■■■■■ 34.6
PCBP1Q15365 DDA1-202ENST00000593466 757 ntTSL 322.18■■□□□ 1.145e-6■■■■■ 34.6
PCBP1Q15365 DDA1-204ENST00000596582 502 ntTSL 321.38■■□□□ 1.015e-6■■■■■ 34.6
PCBP1Q15365 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.855e-6■■■■■ 34.6
PCBP1Q15365 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.753e-7■■■■■ 34.6
PCBP1Q15365 PRKCB-210ENST00000498739 569 ntTSL 418.52■□□□□ 0.562e-7■■■■■ 34.6
PCBP1Q15365 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.515e-6■■■■■ 34.6
PCBP1Q15365 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.413e-7■■■■■ 34.6
PCBP1Q15365 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.42e-7■■■■■ 34.6
PCBP1Q15365 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.123e-7■■■■■ 34.6
PCBP1Q15365 CUTA-203ENST00000374500 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.033e-7■■■■■ 34.6
PCBP1Q15365 CUTA-201ENST00000374484 658 ntTSL 315.22■□□□□ 0.033e-7■■■■■ 34.6
PCBP1Q15365 TIMM44-209ENST00000599650 921 ntTSL 215.02■□□□□ -03e-11■■■■■ 34.6
PCBP1Q15365 CUTA-204ENST00000440279 822 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.13e-7■■■■■ 34.6
PCBP1Q15365 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.162e-7■■■■■ 34.6
PCBP1Q15365 CUTA-206ENST00000465956 961 ntTSL 212.87□□□□□ -0.353e-7■■■■■ 34.6
PCBP1Q15365 CUTA-211ENST00000488478 676 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.543e-7■■■■■ 34.6
PCBP1Q15365 CUTA-209ENST00000487637 1378 ntTSL 211.3□□□□□ -0.63e-7■■■■■ 34.6
PCBP1Q15365 CUTA-205ENST00000462802 1054 ntTSL 1 (best)11.27□□□□□ -0.613e-7■■■■■ 34.6
PCBP1Q15365 DDA1-201ENST00000359866 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.625e-6■■■■■ 34.6
PCBP1Q15365 CUTA-213ENST00000494751 731 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.73e-7■■■■■ 34.6
PCBP1Q15365 CUTA-214ENST00000607266 661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.753e-7■■■■■ 34.6
PCBP1Q15365 CUTA-207ENST00000479249 562 ntTSL 38.6□□□□□ -1.033e-7■■■■■ 34.6
PCBP1Q15365 NLRP1-205ENST00000544378 5281 ntTSL 213.25□□□□□ -0.295e-14■■■■■ 34.5
PCBP1Q15365 NLRP1-202ENST00000269280 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.315e-14■■■■■ 34.5
PCBP1Q15365 NLRP1-208ENST00000571451 5444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.495e-14■■■■■ 34.5
PCBP1Q15365 NLRP1-209ENST00000572143 578 ntTSL 411.83□□□□□ -0.525e-14■■■■■ 34.5
PCBP1Q15365 NLRP1-213ENST00000576905 555 ntTSL 411.44□□□□□ -0.585e-14■■■■■ 34.5
PCBP1Q15365 NLRP1-201ENST00000262467 5131 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.685e-14■■■■■ 34.5
PCBP1Q15365 NLRP1-216ENST00000617618 4788 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.755e-14■■■■■ 34.5
PCBP1Q15365 NLRP1-215ENST00000613500 4494 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.775e-14■■■■■ 34.5
PCBP1Q15365 NLRP1-217ENST00000619223 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.785e-14■■■■■ 34.5
PCBP1Q15365 NLRP1-203ENST00000345221 4656 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.85e-14■■■■■ 34.5
PCBP1Q15365 NLRP1-207ENST00000571307 4050 ntTSL 1 (best)8.54□□□□□ -1.045e-14■■■■■ 34.5
PCBP1Q15365 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.596e-17■■■■■ 34.5
PCBP1Q15365 ARHGDIA-215ENST00000583868 815 ntTSL 315.15■□□□□ 0.026e-17■■■■■ 34.5
PCBP1Q15365 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.566e-6■■■■■ 34.5
PCBP1Q15365 TSNARE1-202ENST00000518720 583 ntTSL 418.82■□□□□ 0.66e-6■■■■■ 34.5
PCBP1Q15365 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.576e-6■■■■■ 34.5
PCBP1Q15365 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.556e-6■■■■■ 34.5
PCBP1Q15365 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.41e-7■■■■■ 34.5
PCBP1Q15365 TSNARE1-206ENST00000520462 589 ntTSL 417.09■□□□□ 0.336e-6■■■■■ 34.5
PCBP1Q15365 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.296e-6■■■■■ 34.5
PCBP1Q15365 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.246e-6■■■■■ 34.5
PCBP1Q15365 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.136e-6■■■■■ 34.5
PCBP1Q15365 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.036e-6■■■■■ 34.5
PCBP1Q15365 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.036e-6■■■■■ 34.5
PCBP1Q15365 CUX1-210ENST00000497815 947 ntTSL 213.06□□□□□ -0.326e-6■■■■■ 34.5
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