Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RUNX3Q13761 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RUNX3Q13761 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RUNX3Q13761 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RUNX3Q13761 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RUNX3Q13761 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RUNX3Q13761 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RUNX3Q13761 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
RUNX3Q13761 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RUNX3Q13761 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RUNX3Q13761 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RUNX3Q13761 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RUNX3Q13761 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RUNX3Q13761 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RUNX3Q13761 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RUNX3Q13761 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RUNX3Q13761 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RUNX3Q13761 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RUNX3Q13761 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RUNX3Q13761 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RUNX3Q13761 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RUNX3Q13761 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RUNX3Q13761 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RUNX3Q13761 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RUNX3Q13761 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RUNX3Q13761 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RUNX3Q13761 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RUNX3Q13761 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RUNX3Q13761 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
RUNX3Q13761 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RUNX3Q13761 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RUNX3Q13761 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RUNX3Q13761 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
RUNX3Q13761 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RUNX3Q13761 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RUNX3Q13761 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RUNX3Q13761 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RUNX3Q13761 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RUNX3Q13761 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RUNX3Q13761 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RUNX3Q13761 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RUNX3Q13761 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RUNX3Q13761 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RUNX3Q13761 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RUNX3Q13761 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RUNX3Q13761 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RUNX3Q13761 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RUNX3Q13761 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RUNX3Q13761 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RUNX3Q13761 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RUNX3Q13761 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RUNX3Q13761 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RUNX3Q13761 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RUNX3Q13761 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RUNX3Q13761 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RUNX3Q13761 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RUNX3Q13761 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RUNX3Q13761 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RUNX3Q13761 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RUNX3Q13761 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RUNX3Q13761 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
RUNX3Q13761 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RUNX3Q13761 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RUNX3Q13761 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RUNX3Q13761 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RUNX3Q13761 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RUNX3Q13761 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RUNX3Q13761 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RUNX3Q13761 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RUNX3Q13761 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RUNX3Q13761 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RUNX3Q13761 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RUNX3Q13761 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RUNX3Q13761 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RUNX3Q13761 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RUNX3Q13761 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RUNX3Q13761 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RUNX3Q13761 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RUNX3Q13761 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RUNX3Q13761 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RUNX3Q13761 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RUNX3Q13761 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RUNX3Q13761 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RUNX3Q13761 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RUNX3Q13761 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
RUNX3Q13761 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
RUNX3Q13761 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RUNX3Q13761 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RUNX3Q13761 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RUNX3Q13761 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RUNX3Q13761 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RUNX3Q13761 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RUNX3Q13761 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RUNX3Q13761 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
RUNX3Q13761 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RUNX3Q13761 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RUNX3Q13761 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RUNX3Q13761 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RUNX3Q13761 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RUNX3Q13761 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms