Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SGCGQ13326 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SGCGQ13326 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SGCGQ13326 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SGCGQ13326 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SGCGQ13326 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SGCGQ13326 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SGCGQ13326 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SGCGQ13326 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SGCGQ13326 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SGCGQ13326 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SGCGQ13326 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SGCGQ13326 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SGCGQ13326 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SGCGQ13326 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SGCGQ13326 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SGCGQ13326 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SGCGQ13326 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SGCGQ13326 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SGCGQ13326 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SGCGQ13326 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SGCGQ13326 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SGCGQ13326 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SGCGQ13326 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SGCGQ13326 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SGCGQ13326 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SGCGQ13326 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SGCGQ13326 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SGCGQ13326 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SGCGQ13326 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SGCGQ13326 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SGCGQ13326 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SGCGQ13326 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SGCGQ13326 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SGCGQ13326 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SGCGQ13326 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SGCGQ13326 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SGCGQ13326 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SGCGQ13326 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SGCGQ13326 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SGCGQ13326 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SGCGQ13326 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SGCGQ13326 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SGCGQ13326 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SGCGQ13326 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SGCGQ13326 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SGCGQ13326 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SGCGQ13326 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SGCGQ13326 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SGCGQ13326 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SGCGQ13326 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SGCGQ13326 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SGCGQ13326 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SGCGQ13326 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SGCGQ13326 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SGCGQ13326 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SGCGQ13326 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SGCGQ13326 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SGCGQ13326 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SGCGQ13326 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SGCGQ13326 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SGCGQ13326 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SGCGQ13326 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SGCGQ13326 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SGCGQ13326 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SGCGQ13326 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SGCGQ13326 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SGCGQ13326 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SGCGQ13326 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SGCGQ13326 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SGCGQ13326 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SGCGQ13326 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SGCGQ13326 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SGCGQ13326 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SGCGQ13326 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SGCGQ13326 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SGCGQ13326 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SGCGQ13326 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SGCGQ13326 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SGCGQ13326 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SGCGQ13326 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SGCGQ13326 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SGCGQ13326 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SGCGQ13326 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SGCGQ13326 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SGCGQ13326 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SGCGQ13326 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SGCGQ13326 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SGCGQ13326 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SGCGQ13326 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SGCGQ13326 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SGCGQ13326 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SGCGQ13326 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SGCGQ13326 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SGCGQ13326 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SGCGQ13326 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SGCGQ13326 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SGCGQ13326 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SGCGQ13326 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SGCGQ13326 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
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