Protein–RNA interactions for Protein: Q13255

GRM1, Metabotropic glutamate receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRM1Q13255 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GRM1Q13255 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GRM1Q13255 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GRM1Q13255 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GRM1Q13255 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GRM1Q13255 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GRM1Q13255 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GRM1Q13255 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GRM1Q13255 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
GRM1Q13255 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
GRM1Q13255 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
GRM1Q13255 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
GRM1Q13255 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GRM1Q13255 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
GRM1Q13255 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GRM1Q13255 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GRM1Q13255 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GRM1Q13255 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GRM1Q13255 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GRM1Q13255 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GRM1Q13255 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GRM1Q13255 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GRM1Q13255 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GRM1Q13255 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GRM1Q13255 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GRM1Q13255 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
GRM1Q13255 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GRM1Q13255 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GRM1Q13255 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GRM1Q13255 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GRM1Q13255 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GRM1Q13255 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
GRM1Q13255 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GRM1Q13255 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GRM1Q13255 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GRM1Q13255 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GRM1Q13255 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GRM1Q13255 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GRM1Q13255 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GRM1Q13255 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GRM1Q13255 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GRM1Q13255 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GRM1Q13255 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GRM1Q13255 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GRM1Q13255 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GRM1Q13255 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GRM1Q13255 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GRM1Q13255 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GRM1Q13255 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GRM1Q13255 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GRM1Q13255 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
GRM1Q13255 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
GRM1Q13255 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
GRM1Q13255 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GRM1Q13255 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
GRM1Q13255 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GRM1Q13255 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GRM1Q13255 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
GRM1Q13255 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
GRM1Q13255 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC27.57■■■□□ 2
GRM1Q13255 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GRM1Q13255 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GRM1Q13255 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GRM1Q13255 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GRM1Q13255 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GRM1Q13255 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GRM1Q13255 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GRM1Q13255 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC27.56■■■□□ 2
GRM1Q13255 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
GRM1Q13255 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
GRM1Q13255 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
GRM1Q13255 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GRM1Q13255 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
GRM1Q13255 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
GRM1Q13255 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
GRM1Q13255 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GRM1Q13255 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GRM1Q13255 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
GRM1Q13255 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
GRM1Q13255 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
GRM1Q13255 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
GRM1Q13255 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
GRM1Q13255 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
GRM1Q13255 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
GRM1Q13255 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.55■■■□□ 2
GRM1Q13255 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
GRM1Q13255 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
GRM1Q13255 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC27.54■■■□□ 2
GRM1Q13255 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GRM1Q13255 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
GRM1Q13255 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC27.54■■■□□ 2
GRM1Q13255 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GRM1Q13255 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
GRM1Q13255 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GRM1Q13255 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GRM1Q13255 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC27.53■■■□□ 2
GRM1Q13255 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC27.53■■■□□ 2
GRM1Q13255 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
GRM1Q13255 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
GRM1Q13255 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms