Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

Predictions only

Length 1,337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPRJQ12913 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPRJQ12913 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPRJQ12913 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPRJQ12913 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPRJQ12913 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPRJQ12913 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPRJQ12913 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPRJQ12913 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPRJQ12913 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPRJQ12913 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPRJQ12913 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPRJQ12913 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPRJQ12913 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPRJQ12913 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPRJQ12913 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPRJQ12913 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPRJQ12913 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPRJQ12913 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPRJQ12913 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPRJQ12913 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPRJQ12913 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPRJQ12913 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPRJQ12913 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPRJQ12913 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPRJQ12913 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPRJQ12913 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPRJQ12913 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPRJQ12913 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPRJQ12913 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPRJQ12913 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPRJQ12913 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPRJQ12913 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPRJQ12913 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPRJQ12913 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPRJQ12913 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPRJQ12913 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPRJQ12913 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPRJQ12913 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPRJQ12913 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPRJQ12913 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPRJQ12913 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPRJQ12913 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPRJQ12913 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPRJQ12913 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPRJQ12913 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPRJQ12913 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPRJQ12913 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPRJQ12913 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPRJQ12913 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPRJQ12913 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPRJQ12913 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPRJQ12913 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPRJQ12913 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPRJQ12913 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPRJQ12913 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPRJQ12913 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPRJQ12913 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPRJQ12913 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPRJQ12913 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
PTPRJQ12913 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PTPRJQ12913 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PTPRJQ12913 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTPRJQ12913 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTPRJQ12913 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTPRJQ12913 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTPRJQ12913 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTPRJQ12913 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPRJQ12913 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPRJQ12913 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPRJQ12913 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPRJQ12913 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPRJQ12913 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPRJQ12913 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPRJQ12913 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPRJQ12913 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPRJQ12913 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPRJQ12913 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPRJQ12913 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPRJQ12913 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPRJQ12913 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPRJQ12913 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPRJQ12913 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPRJQ12913 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPRJQ12913 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPRJQ12913 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPRJQ12913 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPRJQ12913 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPRJQ12913 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPRJQ12913 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPRJQ12913 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPRJQ12913 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPRJQ12913 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPRJQ12913 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPRJQ12913 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPRJQ12913 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPRJQ12913 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPRJQ12913 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPRJQ12913 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPRJQ12913 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms