Protein–RNA interactions for Protein: Q12045

VIK1, Spindle pole body-associated protein VIK1, yeast

Predictions only

Length 647 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VIK1	Q12045	TEF1	YPR080W	1377 nt		5.27	□□□□□ -1.57
VIK1	Q12045	TEF2	YBR118W	1377 nt		5.27	□□□□□ -1.57
VIK1	Q12045	PHO90	YJL198W	2646 nt		5.26	□□□□□ -1.57
VIK1	Q12045	MTQ2	YDR140W	666 nt		5.26	□□□□□ -1.57
VIK1	Q12045	URA3	YEL021W	804 nt		5.26	□□□□□ -1.57
VIK1	Q12045	GRX4	YER174C	735 nt		5.26	□□□□□ -1.57
VIK1	Q12045	RRP4	YHR069C	1080 nt		5.26	□□□□□ -1.57
VIK1	Q12045	YPL136W	YPL136W	369 nt		5.26	□□□□□ -1.57
VIK1	Q12045	BPL1	YDL141W	2073 nt		5.25	□□□□□ -1.57
VIK1	Q12045	AFT1	YGL071W	2073 nt		5.25	□□□□□ -1.57
VIK1	Q12045	RIM15	YFL033C	5313 nt		5.25	□□□□□ -1.57
VIK1	Q12045	ADE13	YLR359W	1449 nt		5.25	□□□□□ -1.57
VIK1	Q12045	IMA1	YGR287C	1770 nt		5.25	□□□□□ -1.57
VIK1	Q12045	PAL1	YDR348C	1500 nt		5.25	□□□□□ -1.57
VIK1	Q12045	PMP3	YDR276C	168 nt		5.25	□□□□□ -1.57
VIK1	Q12045	YEL075W-A	YEL075W-A	612 nt		5.25	□□□□□ -1.57
VIK1	Q12045	SFK1	YKL051W	1062 nt		5.25	□□□□□ -1.57
VIK1	Q12045	SEC39	YLR440C	2130 nt		5.25	□□□□□ -1.57
VIK1	Q12045	YLR463C	YLR463C	552 nt		5.25	□□□□□ -1.57
VIK1	Q12045	TRK2	YKR050W	2670 nt		5.25	□□□□□ -1.57
VIK1	Q12045	GLT1	YDL171C	6438 nt		5.25	□□□□□ -1.57
VIK1	Q12045	DRS1	YLL008W	2259 nt		5.25	□□□□□ -1.57
VIK1	Q12045	UTP7	YER082C	1665 nt		5.24	□□□□□ -1.57
VIK1	Q12045	MCH4	YOL119C	1506 nt		5.24	□□□□□ -1.57
VIK1	Q12045	CTR3	YLR411W	726 nt		5.24	□□□□□ -1.57
VIK1	Q12045	SOL1	YNR034W	966 nt		5.24	□□□□□ -1.57
VIK1	Q12045	snR10	snR10	245 nt		5.24	□□□□□ -1.57
VIK1	Q12045	AAD15	YOL165C	432 nt		5.24	□□□□□ -1.57
VIK1	Q12045	UBA2	YDR390C	1911 nt		5.24	□□□□□ -1.57
VIK1	Q12045	YCL065W	YCL065W	369 nt		5.23	□□□□□ -1.57
VIK1	Q12045	AAD4	YDL243C	990 nt		5.23	□□□□□ -1.57
VIK1	Q12045	VMA16	YHR026W	642 nt		5.23	□□□□□ -1.57
VIK1	Q12045	YML131W	YML131W	1098 nt		5.23	□□□□□ -1.57
VIK1	Q12045	YNL097W-A	YNL097W-A	156 nt		5.23	□□□□□ -1.57
VIK1	Q12045	STE7	YDL159W	1548 nt		5.23	□□□□□ -1.57
VIK1	Q12045	UGO1	YDR470C	1509 nt		5.23	□□□□□ -1.57
VIK1	Q12045	MGS1	YNL218W	1764 nt		5.22	□□□□□ -1.57
VIK1	Q12045	COR1	YBL045C	1374 nt		5.22	□□□□□ -1.57
VIK1	Q12045	MND2	YIR025W	1107 nt		5.22	□□□□□ -1.57
VIK1	Q12045	TIF2	YJL138C	1188 nt		5.22	□□□□□ -1.57
VIK1	Q12045	TIF1	YKR059W	1188 nt		5.22	□□□□□ -1.57
VIK1	Q12045	YLR157W-E	YLR157W-E	165 nt		5.22	□□□□□ -1.57
VIK1	Q12045	SOG2	YOR353C	2376 nt		5.22	□□□□□ -1.57
VIK1	Q12045	MMP1	YLL061W	1752 nt		5.21	□□□□□ -1.57
VIK1	Q12045	SNF3	YDL194W	2655 nt		5.21	□□□□□ -1.57
VIK1	Q12045	VPS72	YDR485C	2388 nt		5.21	□□□□□ -1.57
VIK1	Q12045	YRA1	YDR381W	681 nt		5.21	□□□□□ -1.58
VIK1	Q12045	YDR541C	YDR541C	1035 nt		5.21	□□□□□ -1.58
VIK1	Q12045	RPL12A	YEL054C	498 nt		5.21	□□□□□ -1.58
VIK1	Q12045	YFR035C	YFR035C	345 nt		5.21	□□□□□ -1.58
VIK1	Q12045	ACF2	YLR144C	2340 nt		5.21	□□□□□ -1.58
VIK1	Q12045	NOC4	YPR144C	1659 nt		5.21	□□□□□ -1.58
VIK1	Q12045	YJL107C	YJL107C	1164 nt		5.2	□□□□□ -1.58
VIK1	Q12045	ATG12	YBR217W	561 nt		5.2	□□□□□ -1.58
VIK1	Q12045	GAS3	YMR215W	1575 nt		5.2	□□□□□ -1.58
VIK1	Q12045	PXA1	YPL147W	2613 nt		5.19	□□□□□ -1.58
VIK1	Q12045	ELP2	YGR200C	2367 nt		5.19	□□□□□ -1.58
VIK1	Q12045	YHR182W	YHR182W	2358 nt		5.19	□□□□□ -1.58
VIK1	Q12045	YDL022C-A	YDL022C-A	249 nt		5.19	□□□□□ -1.58
VIK1	Q12045	UGA1	YGR019W	1416 nt		5.18	□□□□□ -1.58
VIK1	Q12045	ORC5	YNL261W	1440 nt		5.18	□□□□□ -1.58
VIK1	Q12045	XPT1	YJR133W	630 nt		5.18	□□□□□ -1.58
VIK1	Q12045	STE50	YCL032W	1041 nt		5.18	□□□□□ -1.58
VIK1	Q12045	HRP1	YOL123W	1605 nt		5.18	□□□□□ -1.58
VIK1	Q12045	TUP1	YCR084C	2142 nt		5.18	□□□□□ -1.58
VIK1	Q12045	YOR1	YGR281W	4434 nt		5.18	□□□□□ -1.58
VIK1	Q12045	YMD8	YML038C	1329 nt		5.18	□□□□□ -1.58
VIK1	Q12045	PSE1	YMR308C	3270 nt		5.17	□□□□□ -1.58
VIK1	Q12045	YPR195C	YPR195C	330 nt		5.17	□□□□□ -1.58
VIK1	Q12045	YIL067C	YIL067C	2037 nt		5.17	□□□□□ -1.58
VIK1	Q12045	HOF1	YMR032W	2010 nt		5.17	□□□□□ -1.58
VIK1	Q12045	MRK1	YDL079C	1506 nt		5.17	□□□□□ -1.58
VIK1	Q12045	DBF2	YGR092W	1719 nt		5.17	□□□□□ -1.58
VIK1	Q12045	ADE6	YGR061C	4077 nt		5.16	□□□□□ -1.58
VIK1	Q12045	MNS1	YJR131W	1650 nt		5.16	□□□□□ -1.58
VIK1	Q12045	PGA3	YML125C	939 nt		5.16	□□□□□ -1.58
VIK1	Q12045	OST3	YOR085W	1053 nt		5.16	□□□□□ -1.58
VIK1	Q12045	GDB1	YPR184W	4611 nt		5.16	□□□□□ -1.58
VIK1	Q12045	YTA6	YPL074W	2265 nt		5.15	□□□□□ -1.58
VIK1	Q12045	PEX19	YDL065C	1029 nt		5.15	□□□□□ -1.59
VIK1	Q12045	RPS16B	YDL083C	432 nt		5.15	□□□□□ -1.59
VIK1	Q12045	YER084W	YER084W	387 nt		5.15	□□□□□ -1.59
VIK1	Q12045	YHR212W-A	YHR212W-A	204 nt		5.15	□□□□□ -1.59
VIK1	Q12045	MOG1	YJR074W	657 nt		5.15	□□□□□ -1.59
VIK1	Q12045	YAR061W	YAR061W	204 nt		5.15	□□□□□ -1.59
VIK1	Q12045	UBC4	YBR082C	447 nt		5.15	□□□□□ -1.59
VIK1	Q12045	PUS1	YPL212C	1635 nt		5.15	□□□□□ -1.59
VIK1	Q12045	TDA7	YNL176C	1911 nt		5.15	□□□□□ -1.59
VIK1	Q12045	CTS1	YLR286C	1689 nt		5.15	□□□□□ -1.59
VIK1	Q12045	SIT4	YDL047W	936 nt		5.14	□□□□□ -1.59
VIK1	Q12045	ZRT1	YGL255W	1131 nt		5.14	□□□□□ -1.59
VIK1	Q12045	CAX4	YGR036C	720 nt		5.14	□□□□□ -1.59
VIK1	Q12045	GTO1	YGR154C	1071 nt		5.14	□□□□□ -1.59
VIK1	Q12045	JJJ3	YJR097W	519 nt		5.14	□□□□□ -1.59
VIK1	Q12045	YLR346C	YLR346C	306 nt		5.14	□□□□□ -1.59
VIK1	Q12045	HLJ1	YMR161W	675 nt		5.14	□□□□□ -1.59
VIK1	Q12045	LEM3	YNL323W	1245 nt		5.14	□□□□□ -1.59
VIK1	Q12045	YNR048W	YNR048W	1182 nt		5.14	□□□□□ -1.59
VIK1	Q12045	CAF4	YKR036C	1932 nt		5.14	□□□□□ -1.59
VIK1	Q12045	VHS2	YIL135C	1311 nt		5.14	□□□□□ -1.59

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