Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAQ4

SMAGP, Small cell adhesion glycoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAGPQ0VAQ4 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SMAGPQ0VAQ4 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMAGPQ0VAQ4 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SMAGPQ0VAQ4 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMAGPQ0VAQ4 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SMAGPQ0VAQ4 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SMAGPQ0VAQ4 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SMAGPQ0VAQ4 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SMAGPQ0VAQ4 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SMAGPQ0VAQ4 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SMAGPQ0VAQ4 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SMAGPQ0VAQ4 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SMAGPQ0VAQ4 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SMAGPQ0VAQ4 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMAGPQ0VAQ4 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMAGPQ0VAQ4 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMAGPQ0VAQ4 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMAGPQ0VAQ4 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMAGPQ0VAQ4 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMAGPQ0VAQ4 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMAGPQ0VAQ4 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMAGPQ0VAQ4 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMAGPQ0VAQ4 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMAGPQ0VAQ4 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMAGPQ0VAQ4 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMAGPQ0VAQ4 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMAGPQ0VAQ4 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMAGPQ0VAQ4 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMAGPQ0VAQ4 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMAGPQ0VAQ4 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMAGPQ0VAQ4 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMAGPQ0VAQ4 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMAGPQ0VAQ4 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMAGPQ0VAQ4 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMAGPQ0VAQ4 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMAGPQ0VAQ4 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMAGPQ0VAQ4 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SMAGPQ0VAQ4 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMAGPQ0VAQ4 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMAGPQ0VAQ4 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMAGPQ0VAQ4 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMAGPQ0VAQ4 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMAGPQ0VAQ4 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMAGPQ0VAQ4 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMAGPQ0VAQ4 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMAGPQ0VAQ4 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMAGPQ0VAQ4 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMAGPQ0VAQ4 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMAGPQ0VAQ4 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMAGPQ0VAQ4 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMAGPQ0VAQ4 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMAGPQ0VAQ4 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMAGPQ0VAQ4 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMAGPQ0VAQ4 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMAGPQ0VAQ4 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMAGPQ0VAQ4 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMAGPQ0VAQ4 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SMAGPQ0VAQ4 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMAGPQ0VAQ4 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMAGPQ0VAQ4 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMAGPQ0VAQ4 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMAGPQ0VAQ4 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMAGPQ0VAQ4 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMAGPQ0VAQ4 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SMAGPQ0VAQ4 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SMAGPQ0VAQ4 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SMAGPQ0VAQ4 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMAGPQ0VAQ4 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMAGPQ0VAQ4 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMAGPQ0VAQ4 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMAGPQ0VAQ4 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SMAGPQ0VAQ4 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMAGPQ0VAQ4 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMAGPQ0VAQ4 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMAGPQ0VAQ4 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMAGPQ0VAQ4 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMAGPQ0VAQ4 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMAGPQ0VAQ4 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMAGPQ0VAQ4 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMAGPQ0VAQ4 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMAGPQ0VAQ4 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMAGPQ0VAQ4 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMAGPQ0VAQ4 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMAGPQ0VAQ4 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMAGPQ0VAQ4 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMAGPQ0VAQ4 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMAGPQ0VAQ4 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMAGPQ0VAQ4 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMAGPQ0VAQ4 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMAGPQ0VAQ4 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMAGPQ0VAQ4 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SMAGPQ0VAQ4 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMAGPQ0VAQ4 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMAGPQ0VAQ4 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMAGPQ0VAQ4 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMAGPQ0VAQ4 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMAGPQ0VAQ4 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMAGPQ0VAQ4 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMAGPQ0VAQ4 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMAGPQ0VAQ4 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms