Protein–RNA interactions for Protein: Q0II04

Nebl, Nebulette, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NeblQ0II04 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NeblQ0II04 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NeblQ0II04 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NeblQ0II04 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NeblQ0II04 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NeblQ0II04 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NeblQ0II04 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NeblQ0II04 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NeblQ0II04 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NeblQ0II04 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NeblQ0II04 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NeblQ0II04 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NeblQ0II04 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NeblQ0II04 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NeblQ0II04 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NeblQ0II04 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NeblQ0II04 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NeblQ0II04 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NeblQ0II04 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NeblQ0II04 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NeblQ0II04 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NeblQ0II04 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NeblQ0II04 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NeblQ0II04 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NeblQ0II04 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NeblQ0II04 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NeblQ0II04 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NeblQ0II04 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NeblQ0II04 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NeblQ0II04 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NeblQ0II04 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NeblQ0II04 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NeblQ0II04 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NeblQ0II04 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NeblQ0II04 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NeblQ0II04 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NeblQ0II04 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NeblQ0II04 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NeblQ0II04 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NeblQ0II04 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NeblQ0II04 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NeblQ0II04 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NeblQ0II04 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NeblQ0II04 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NeblQ0II04 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NeblQ0II04 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NeblQ0II04 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NeblQ0II04 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NeblQ0II04 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NeblQ0II04 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NeblQ0II04 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NeblQ0II04 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NeblQ0II04 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NeblQ0II04 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NeblQ0II04 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NeblQ0II04 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NeblQ0II04 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NeblQ0II04 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NeblQ0II04 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NeblQ0II04 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NeblQ0II04 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NeblQ0II04 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NeblQ0II04 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NeblQ0II04 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NeblQ0II04 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NeblQ0II04 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NeblQ0II04 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NeblQ0II04 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NeblQ0II04 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NeblQ0II04 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NeblQ0II04 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NeblQ0II04 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NeblQ0II04 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NeblQ0II04 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NeblQ0II04 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NeblQ0II04 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NeblQ0II04 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NeblQ0II04 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NeblQ0II04 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NeblQ0II04 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NeblQ0II04 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NeblQ0II04 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NeblQ0II04 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NeblQ0II04 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NeblQ0II04 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NeblQ0II04 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NeblQ0II04 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NeblQ0II04 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NeblQ0II04 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NeblQ0II04 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NeblQ0II04 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NeblQ0II04 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NeblQ0II04 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NeblQ0II04 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NeblQ0II04 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NeblQ0II04 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NeblQ0II04 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NeblQ0II04 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NeblQ0II04 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NeblQ0II04 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms