Protein–RNA interactions for Protein: Q08188

TGM3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM3Q08188 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TGM3Q08188 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TGM3Q08188 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TGM3Q08188 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TGM3Q08188 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TGM3Q08188 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TGM3Q08188 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TGM3Q08188 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TGM3Q08188 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TGM3Q08188 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TGM3Q08188 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TGM3Q08188 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TGM3Q08188 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TGM3Q08188 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TGM3Q08188 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TGM3Q08188 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TGM3Q08188 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TGM3Q08188 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TGM3Q08188 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TGM3Q08188 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TGM3Q08188 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TGM3Q08188 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TGM3Q08188 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TGM3Q08188 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TGM3Q08188 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
TGM3Q08188 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TGM3Q08188 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TGM3Q08188 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TGM3Q08188 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TGM3Q08188 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TGM3Q08188 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TGM3Q08188 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TGM3Q08188 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TGM3Q08188 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TGM3Q08188 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TGM3Q08188 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TGM3Q08188 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TGM3Q08188 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TGM3Q08188 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TGM3Q08188 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TGM3Q08188 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TGM3Q08188 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TGM3Q08188 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TGM3Q08188 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TGM3Q08188 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TGM3Q08188 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TGM3Q08188 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TGM3Q08188 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TGM3Q08188 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TGM3Q08188 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TGM3Q08188 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TGM3Q08188 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TGM3Q08188 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TGM3Q08188 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TGM3Q08188 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TGM3Q08188 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TGM3Q08188 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TGM3Q08188 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TGM3Q08188 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TGM3Q08188 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TGM3Q08188 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TGM3Q08188 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TGM3Q08188 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TGM3Q08188 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TGM3Q08188 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TGM3Q08188 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TGM3Q08188 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TGM3Q08188 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TGM3Q08188 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TGM3Q08188 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TGM3Q08188 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TGM3Q08188 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TGM3Q08188 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TGM3Q08188 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TGM3Q08188 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TGM3Q08188 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TGM3Q08188 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TGM3Q08188 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TGM3Q08188 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TGM3Q08188 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TGM3Q08188 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TGM3Q08188 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TGM3Q08188 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TGM3Q08188 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TGM3Q08188 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TGM3Q08188 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TGM3Q08188 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TGM3Q08188 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TGM3Q08188 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TGM3Q08188 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TGM3Q08188 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TGM3Q08188 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TGM3Q08188 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TGM3Q08188 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TGM3Q08188 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TGM3Q08188 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TGM3Q08188 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TGM3Q08188 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TGM3Q08188 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TGM3Q08188 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms