Protein–RNA interactions for Protein: Q07869

PPARA, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARAQ07869 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PPARAQ07869 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PPARAQ07869 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PPARAQ07869 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PPARAQ07869 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PPARAQ07869 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PPARAQ07869 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PPARAQ07869 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
PPARAQ07869 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PPARAQ07869 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PPARAQ07869 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PPARAQ07869 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
PPARAQ07869 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PPARAQ07869 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PPARAQ07869 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PPARAQ07869 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
PPARAQ07869 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PPARAQ07869 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PPARAQ07869 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PPARAQ07869 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PPARAQ07869 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PPARAQ07869 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
PPARAQ07869 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PPARAQ07869 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PPARAQ07869 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PPARAQ07869 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
PPARAQ07869 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PPARAQ07869 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
PPARAQ07869 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PPARAQ07869 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PPARAQ07869 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PPARAQ07869 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PPARAQ07869 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PPARAQ07869 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PPARAQ07869 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PPARAQ07869 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PPARAQ07869 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PPARAQ07869 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
PPARAQ07869 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PPARAQ07869 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PPARAQ07869 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PPARAQ07869 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PPARAQ07869 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PPARAQ07869 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PPARAQ07869 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PPARAQ07869 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PPARAQ07869 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PPARAQ07869 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PPARAQ07869 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PPARAQ07869 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
PPARAQ07869 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PPARAQ07869 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PPARAQ07869 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PPARAQ07869 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PPARAQ07869 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PPARAQ07869 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PPARAQ07869 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PPARAQ07869 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PPARAQ07869 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PPARAQ07869 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PPARAQ07869 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PPARAQ07869 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PPARAQ07869 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PPARAQ07869 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PPARAQ07869 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PPARAQ07869 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PPARAQ07869 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PPARAQ07869 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PPARAQ07869 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PPARAQ07869 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PPARAQ07869 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PPARAQ07869 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PPARAQ07869 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PPARAQ07869 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PPARAQ07869 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PPARAQ07869 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PPARAQ07869 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PPARAQ07869 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PPARAQ07869 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PPARAQ07869 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PPARAQ07869 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PPARAQ07869 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PPARAQ07869 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PPARAQ07869 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PPARAQ07869 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PPARAQ07869 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PPARAQ07869 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PPARAQ07869 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PPARAQ07869 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PPARAQ07869 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PPARAQ07869 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PPARAQ07869 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PPARAQ07869 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PPARAQ07869 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PPARAQ07869 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PPARAQ07869 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PPARAQ07869 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PPARAQ07869 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PPARAQ07869 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
PPARAQ07869 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms