Protein–RNA interactions for Protein: Q07646

Mest, Mesoderm-specific transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MestQ07646 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MestQ07646 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MestQ07646 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MestQ07646 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MestQ07646 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MestQ07646 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
MestQ07646 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
MestQ07646 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MestQ07646 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MestQ07646 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MestQ07646 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MestQ07646 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MestQ07646 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
MestQ07646 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MestQ07646 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MestQ07646 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
MestQ07646 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
MestQ07646 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MestQ07646 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MestQ07646 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MestQ07646 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MestQ07646 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MestQ07646 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
MestQ07646 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
MestQ07646 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
MestQ07646 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MestQ07646 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
MestQ07646 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MestQ07646 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MestQ07646 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MestQ07646 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MestQ07646 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
MestQ07646 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MestQ07646 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
MestQ07646 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
MestQ07646 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
MestQ07646 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
MestQ07646 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
MestQ07646 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
MestQ07646 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
MestQ07646 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
MestQ07646 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
MestQ07646 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
MestQ07646 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
MestQ07646 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
MestQ07646 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
MestQ07646 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.59
MestQ07646 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
MestQ07646 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
MestQ07646 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MestQ07646 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MestQ07646 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MestQ07646 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MestQ07646 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MestQ07646 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MestQ07646 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MestQ07646 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
MestQ07646 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MestQ07646 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MestQ07646 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MestQ07646 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MestQ07646 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MestQ07646 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MestQ07646 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MestQ07646 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MestQ07646 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MestQ07646 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MestQ07646 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MestQ07646 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MestQ07646 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
MestQ07646 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MestQ07646 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MestQ07646 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MestQ07646 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MestQ07646 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MestQ07646 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MestQ07646 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MestQ07646 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MestQ07646 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MestQ07646 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MestQ07646 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MestQ07646 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
MestQ07646 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MestQ07646 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MestQ07646 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MestQ07646 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MestQ07646 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
MestQ07646 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MestQ07646 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MestQ07646 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MestQ07646 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MestQ07646 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
MestQ07646 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MestQ07646 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MestQ07646 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MestQ07646 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MestQ07646 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MestQ07646 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MestQ07646 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
MestQ07646 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms