Protein–RNA interactions for Protein: Q07478

SUB2, ATP-dependent RNA helicase SUB2, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SUB2Q07478 GRX1YCL035C 333 nt7.48□□□□□ -1.21
SUB2Q07478 UBP9YER098W 2265 nt7.48□□□□□ -1.21
SUB2Q07478 DOT1YDR440W 1749 nt7.47□□□□□ -1.21
SUB2Q07478 YIL108WYIL108W 2091 nt7.47□□□□□ -1.21
SUB2Q07478 BUD30YDL151C 582 nt7.47□□□□□ -1.21
SUB2Q07478 SPC3YLR066W 555 nt7.47□□□□□ -1.21
SUB2Q07478 PCD1YLR151C 1023 nt7.47□□□□□ -1.21
SUB2Q07478 MID2YLR332W 1131 nt7.47□□□□□ -1.21
SUB2Q07478 YML083CYML083C 1257 nt7.47□□□□□ -1.21
SUB2Q07478 YOR062CYOR062C 807 nt7.47□□□□□ -1.21
SUB2Q07478 SPS4YOR313C 1017 nt7.47□□□□□ -1.21
SUB2Q07478 MSG5YNL053W 1470 nt7.47□□□□□ -1.21
SUB2Q07478 YDR098C-AYDR098C-A 1323 nt7.47□□□□□ -1.21
SUB2Q07478 YDR210C-CYDR210C-C 1323 nt7.47□□□□□ -1.21
SUB2Q07478 YDR261C-CYDR261C-C 1323 nt7.47□□□□□ -1.21
SUB2Q07478 YDR316W-AYDR316W-A 1323 nt7.47□□□□□ -1.21
SUB2Q07478 PEX3YDR329C 1326 nt7.47□□□□□ -1.21
SUB2Q07478 YDR365W-AYDR365W-A 1323 nt7.47□□□□□ -1.21
SUB2Q07478 YER137C-AYER137C-A 1323 nt7.47□□□□□ -1.21
SUB2Q07478 YER159C-AYER159C-A 1323 nt7.47□□□□□ -1.21
SUB2Q07478 YGR027W-AYGR027W-A 1323 nt7.47□□□□□ -1.21
SUB2Q07478 YGR038C-AYGR038C-A 1323 nt7.47□□□□□ -1.21
SUB2Q07478 YGR161C-CYGR161C-C 1323 nt7.47□□□□□ -1.21
SUB2Q07478 YJR026WYJR026W 1323 nt7.47□□□□□ -1.21
SUB2Q07478 YJR028WYJR028W 1323 nt7.47□□□□□ -1.21
SUB2Q07478 YAR010CYAR010C 1323 nt7.47□□□□□ -1.21
SUB2Q07478 YLR157C-AYLR157C-A 1323 nt7.47□□□□□ -1.21
SUB2Q07478 YLR227W-AYLR227W-A 1323 nt7.47□□□□□ -1.21
SUB2Q07478 YLR256W-AYLR256W-A 1323 nt7.47□□□□□ -1.21
SUB2Q07478 YML040WYML040W 1323 nt7.47□□□□□ -1.21
SUB2Q07478 YML045W-AYML045W-A 1323 nt7.47□□□□□ -1.21
SUB2Q07478 YMR051CYMR051C 1323 nt7.47□□□□□ -1.21
SUB2Q07478 YNL054W-AYNL054W-A 1323 nt7.47□□□□□ -1.21
SUB2Q07478 YOL103W-AYOL103W-A 1323 nt7.47□□□□□ -1.21
SUB2Q07478 YPL257W-AYPL257W-A 1323 nt7.47□□□□□ -1.21
SUB2Q07478 YPR137C-AYPR137C-A 1323 nt7.47□□□□□ -1.21
SUB2Q07478 YPR158C-CYPR158C-C 1323 nt7.47□□□□□ -1.21
SUB2Q07478 SIR1YKR101W 1965 nt7.46□□□□□ -1.21
SUB2Q07478 MAL31YBR298C 1845 nt7.46□□□□□ -1.21
SUB2Q07478 ECM1YAL059W 639 nt7.46□□□□□ -1.22
SUB2Q07478 YLR307C-AYLR307C-A 264 nt7.46□□□□□ -1.22
SUB2Q07478 NIT3YLR351C 876 nt7.46□□□□□ -1.22
SUB2Q07478 MRPL23YOR150W 492 nt7.46□□□□□ -1.22
SUB2Q07478 YDR445CYDR445C 408 nt7.45□□□□□ -1.22
SUB2Q07478 RAD10YML095C 633 nt7.45□□□□□ -1.22
SUB2Q07478 RPS28AYOR167C 204 nt7.45□□□□□ -1.22
SUB2Q07478 ECM8YBR076W 1065 nt7.45□□□□□ -1.22
SUB2Q07478 CDC23YHR166C 1881 nt7.45□□□□□ -1.22
SUB2Q07478 SMP1YBR182C 1359 nt7.45□□□□□ -1.22
SUB2Q07478 FCP1YMR277W 2199 nt7.44□□□□□ -1.22
SUB2Q07478 MPC2YHR162W 390 nt7.44□□□□□ -1.22
SUB2Q07478 FPR3YML074C 1236 nt7.44□□□□□ -1.22
SUB2Q07478 BBP1YPL255W 1158 nt7.44□□□□□ -1.22
SUB2Q07478 YFL041W-AYFL041W-A 192 nt7.43□□□□□ -1.22
SUB2Q07478 BGL2YGR282C 942 nt7.43□□□□□ -1.22
SUB2Q07478 YAL066WYAL066W 309 nt7.43□□□□□ -1.22
SUB2Q07478 YOR097CYOR097C 528 nt7.43□□□□□ -1.22
SUB2Q07478 TIF5YPR041W 1218 nt7.43□□□□□ -1.22
SUB2Q07478 YBR292CYBR292C 372 nt7.43□□□□□ -1.22
SUB2Q07478 YCL041CYCL041C 495 nt7.43□□□□□ -1.22
SUB2Q07478 RAD57YDR004W 1383 nt7.43□□□□□ -1.22
SUB2Q07478 IBA57YJR122W 1494 nt7.43□□□□□ -1.22
SUB2Q07478 HXT17YNR072W 1695 nt7.42□□□□□ -1.22
SUB2Q07478 HXT9YJL219W 1704 nt7.42□□□□□ -1.22
SUB2Q07478 RPR2YIR015W 435 nt7.42□□□□□ -1.22
SUB2Q07478 AIM34YMR003W 597 nt7.42□□□□□ -1.22
SUB2Q07478 YNL217WYNL217W 981 nt7.42□□□□□ -1.22
SUB2Q07478 CPR8YNR028W 927 nt7.42□□□□□ -1.22
SUB2Q07478 CKB2YOR039W 777 nt7.42□□□□□ -1.22
SUB2Q07478 YBR134WYBR134W 402 nt7.42□□□□□ -1.22
SUB2Q07478 GEX2YKR106W 1848 nt7.42□□□□□ -1.22
SUB2Q07478 IRC5YFR038W 2562 nt7.42□□□□□ -1.22
SUB2Q07478 KCH1YJR054W 1494 nt7.42□□□□□ -1.22
SUB2Q07478 YMR1YJR110W 2067 nt7.42□□□□□ -1.22
SUB2Q07478 DSF1YEL070W 1509 nt7.42□□□□□ -1.22
SUB2Q07478 YNR073CYNR073C 1509 nt7.42□□□□□ -1.22
SUB2Q07478 YMR279CYMR279C 1623 nt7.41□□□□□ -1.22
SUB2Q07478 CCT8YJL008C 1707 nt7.41□□□□□ -1.22
SUB2Q07478 PPH22YDL188C 1134 nt7.41□□□□□ -1.22
SUB2Q07478 RML2YEL050C 1182 nt7.41□□□□□ -1.22
SUB2Q07478 ECM9YKR004C 1134 nt7.41□□□□□ -1.22
SUB2Q07478 YLR049CYLR049C 1287 nt7.41□□□□□ -1.22
SUB2Q07478 REX4YOL080C 870 nt7.41□□□□□ -1.22
SUB2Q07478 CAR1YPL111W 1002 nt7.41□□□□□ -1.22
SUB2Q07478 YDR034C-CYDR034C-C 1317 nt7.41□□□□□ -1.22
SUB2Q07478 YLR410W-AYLR410W-A 1317 nt7.41□□□□□ -1.22
SUB2Q07478 COX10YPL172C 1389 nt7.41□□□□□ -1.22
SUB2Q07478 PBI1YPL272C 1554 nt7.41□□□□□ -1.22
SUB2Q07478 TIM22YDL217C 624 nt7.4□□□□□ -1.22
SUB2Q07478 KSS1YGR040W 1107 nt7.4□□□□□ -1.22
SUB2Q07478 ERG25YGR060W 930 nt7.4□□□□□ -1.22
SUB2Q07478 YIL152WYIL152W 708 nt7.4□□□□□ -1.22
SUB2Q07478 SPE4YLR146C 903 nt7.4□□□□□ -1.22
SUB2Q07478 HEK2YBL032W 1146 nt7.4□□□□□ -1.22
SUB2Q07478 HOS1YPR068C 1413 nt7.4□□□□□ -1.22
SUB2Q07478 EXG2YDR261C 1689 nt7.4□□□□□ -1.23
SUB2Q07478 MSB3YNL293W 1902 nt7.39□□□□□ -1.23
SUB2Q07478 RNY1YPL123C 1305 nt7.39□□□□□ -1.23
SUB2Q07478 YJR096WYJR096W 849 nt7.39□□□□□ -1.23
SUB2Q07478 ZRT2YLR130C 1269 nt7.39□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 34.3 ms