Protein–RNA interactions for Protein: Q07105

Gdf9, Growth/differentiation factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf9Q07105 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gdf9Q07105 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gdf9Q07105 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gdf9Q07105 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gdf9Q07105 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gdf9Q07105 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gdf9Q07105 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gdf9Q07105 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gdf9Q07105 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gdf9Q07105 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gdf9Q07105 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gdf9Q07105 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gdf9Q07105 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gdf9Q07105 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gdf9Q07105 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Gdf9Q07105 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gdf9Q07105 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gdf9Q07105 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gdf9Q07105 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gdf9Q07105 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gdf9Q07105 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gdf9Q07105 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gdf9Q07105 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gdf9Q07105 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gdf9Q07105 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gdf9Q07105 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gdf9Q07105 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gdf9Q07105 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gdf9Q07105 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Gdf9Q07105 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Gdf9Q07105 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gdf9Q07105 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gdf9Q07105 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gdf9Q07105 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gdf9Q07105 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gdf9Q07105 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gdf9Q07105 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gdf9Q07105 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gdf9Q07105 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gdf9Q07105 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gdf9Q07105 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gdf9Q07105 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gdf9Q07105 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gdf9Q07105 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gdf9Q07105 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gdf9Q07105 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Gdf9Q07105 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gdf9Q07105 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gdf9Q07105 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gdf9Q07105 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gdf9Q07105 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gdf9Q07105 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gdf9Q07105 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gdf9Q07105 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gdf9Q07105 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Gdf9Q07105 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gdf9Q07105 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gdf9Q07105 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gdf9Q07105 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gdf9Q07105 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Gdf9Q07105 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gdf9Q07105 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gdf9Q07105 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gdf9Q07105 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gdf9Q07105 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gdf9Q07105 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gdf9Q07105 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gdf9Q07105 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gdf9Q07105 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gdf9Q07105 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gdf9Q07105 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gdf9Q07105 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gdf9Q07105 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gdf9Q07105 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gdf9Q07105 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gdf9Q07105 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gdf9Q07105 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gdf9Q07105 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gdf9Q07105 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gdf9Q07105 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gdf9Q07105 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gdf9Q07105 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gdf9Q07105 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gdf9Q07105 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gdf9Q07105 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gdf9Q07105 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gdf9Q07105 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gdf9Q07105 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gdf9Q07105 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gdf9Q07105 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gdf9Q07105 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gdf9Q07105 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gdf9Q07105 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gdf9Q07105 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gdf9Q07105 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gdf9Q07105 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gdf9Q07105 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Gdf9Q07105 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gdf9Q07105 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gdf9Q07105 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.3 ms