Protein–RNA interactions for Protein: Q06806

Tie1, Tyrosine-protein kinase receptor Tie-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tie1Q06806 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tie1Q06806 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Tie1Q06806 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tie1Q06806 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tie1Q06806 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tie1Q06806 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tie1Q06806 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tie1Q06806 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Tie1Q06806 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tie1Q06806 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tie1Q06806 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tie1Q06806 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tie1Q06806 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tie1Q06806 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tie1Q06806 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tie1Q06806 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tie1Q06806 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tie1Q06806 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tie1Q06806 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tie1Q06806 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tie1Q06806 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tie1Q06806 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tie1Q06806 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tie1Q06806 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tie1Q06806 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tie1Q06806 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tie1Q06806 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tie1Q06806 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tie1Q06806 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tie1Q06806 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tie1Q06806 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tie1Q06806 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tie1Q06806 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tie1Q06806 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tie1Q06806 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Tie1Q06806 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tie1Q06806 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tie1Q06806 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tie1Q06806 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tie1Q06806 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tie1Q06806 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tie1Q06806 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tie1Q06806 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tie1Q06806 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tie1Q06806 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tie1Q06806 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tie1Q06806 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tie1Q06806 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tie1Q06806 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tie1Q06806 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tie1Q06806 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Tie1Q06806 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tie1Q06806 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tie1Q06806 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tie1Q06806 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tie1Q06806 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tie1Q06806 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tie1Q06806 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tie1Q06806 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tie1Q06806 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Tie1Q06806 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tie1Q06806 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tie1Q06806 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tie1Q06806 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tie1Q06806 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tie1Q06806 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Tie1Q06806 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tie1Q06806 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Tie1Q06806 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tie1Q06806 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tie1Q06806 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tie1Q06806 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tie1Q06806 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tie1Q06806 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tie1Q06806 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tie1Q06806 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tie1Q06806 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tie1Q06806 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tie1Q06806 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tie1Q06806 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tie1Q06806 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tie1Q06806 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tie1Q06806 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tie1Q06806 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tie1Q06806 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tie1Q06806 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tie1Q06806 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tie1Q06806 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tie1Q06806 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tie1Q06806 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tie1Q06806 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tie1Q06806 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tie1Q06806 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tie1Q06806 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tie1Q06806 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tie1Q06806 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tie1Q06806 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tie1Q06806 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tie1Q06806 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tie1Q06806 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 140.8 ms