Protein–RNA interactions for Protein: Q06348

Prrx2, Paired mesoderm homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx2Q06348 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Prrx2Q06348 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prrx2Q06348 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prrx2Q06348 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prrx2Q06348 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prrx2Q06348 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prrx2Q06348 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prrx2Q06348 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prrx2Q06348 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prrx2Q06348 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prrx2Q06348 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prrx2Q06348 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prrx2Q06348 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Prrx2Q06348 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prrx2Q06348 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prrx2Q06348 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prrx2Q06348 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prrx2Q06348 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prrx2Q06348 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prrx2Q06348 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prrx2Q06348 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prrx2Q06348 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prrx2Q06348 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prrx2Q06348 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prrx2Q06348 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prrx2Q06348 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prrx2Q06348 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prrx2Q06348 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prrx2Q06348 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prrx2Q06348 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prrx2Q06348 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Prrx2Q06348 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prrx2Q06348 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prrx2Q06348 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Prrx2Q06348 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prrx2Q06348 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prrx2Q06348 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prrx2Q06348 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prrx2Q06348 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prrx2Q06348 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prrx2Q06348 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prrx2Q06348 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Prrx2Q06348 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Prrx2Q06348 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Prrx2Q06348 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prrx2Q06348 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prrx2Q06348 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prrx2Q06348 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prrx2Q06348 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prrx2Q06348 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prrx2Q06348 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Prrx2Q06348 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Prrx2Q06348 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prrx2Q06348 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prrx2Q06348 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Prrx2Q06348 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prrx2Q06348 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prrx2Q06348 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Prrx2Q06348 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prrx2Q06348 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prrx2Q06348 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prrx2Q06348 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prrx2Q06348 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prrx2Q06348 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prrx2Q06348 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prrx2Q06348 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prrx2Q06348 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prrx2Q06348 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prrx2Q06348 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prrx2Q06348 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prrx2Q06348 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prrx2Q06348 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prrx2Q06348 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prrx2Q06348 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prrx2Q06348 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prrx2Q06348 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prrx2Q06348 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Prrx2Q06348 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prrx2Q06348 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prrx2Q06348 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prrx2Q06348 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prrx2Q06348 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prrx2Q06348 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prrx2Q06348 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prrx2Q06348 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prrx2Q06348 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prrx2Q06348 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prrx2Q06348 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prrx2Q06348 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prrx2Q06348 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prrx2Q06348 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Prrx2Q06348 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prrx2Q06348 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prrx2Q06348 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prrx2Q06348 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prrx2Q06348 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prrx2Q06348 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prrx2Q06348 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prrx2Q06348 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prrx2Q06348 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms