Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CTDSPL2Q05D32 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CTDSPL2Q05D32 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CTDSPL2Q05D32 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CTDSPL2Q05D32 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CTDSPL2Q05D32 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CTDSPL2Q05D32 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CTDSPL2Q05D32 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CTDSPL2Q05D32 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CTDSPL2Q05D32 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CTDSPL2Q05D32 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CTDSPL2Q05D32 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CTDSPL2Q05D32 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CTDSPL2Q05D32 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CTDSPL2Q05D32 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CTDSPL2Q05D32 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CTDSPL2Q05D32 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
CTDSPL2Q05D32 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CTDSPL2Q05D32 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
CTDSPL2Q05D32 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CTDSPL2Q05D32 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CTDSPL2Q05D32 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CTDSPL2Q05D32 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CTDSPL2Q05D32 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CTDSPL2Q05D32 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CTDSPL2Q05D32 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CTDSPL2Q05D32 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CTDSPL2Q05D32 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CTDSPL2Q05D32 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CTDSPL2Q05D32 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CTDSPL2Q05D32 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CTDSPL2Q05D32 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CTDSPL2Q05D32 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CTDSPL2Q05D32 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CTDSPL2Q05D32 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CTDSPL2Q05D32 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
CTDSPL2Q05D32 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CTDSPL2Q05D32 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CTDSPL2Q05D32 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CTDSPL2Q05D32 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CTDSPL2Q05D32 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CTDSPL2Q05D32 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
CTDSPL2Q05D32 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
CTDSPL2Q05D32 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CTDSPL2Q05D32 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CTDSPL2Q05D32 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
CTDSPL2Q05D32 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CTDSPL2Q05D32 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CTDSPL2Q05D32 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CTDSPL2Q05D32 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CTDSPL2Q05D32 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CTDSPL2Q05D32 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CTDSPL2Q05D32 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CTDSPL2Q05D32 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CTDSPL2Q05D32 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CTDSPL2Q05D32 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CTDSPL2Q05D32 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
CTDSPL2Q05D32 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CTDSPL2Q05D32 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CTDSPL2Q05D32 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CTDSPL2Q05D32 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CTDSPL2Q05D32 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CTDSPL2Q05D32 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CTDSPL2Q05D32 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CTDSPL2Q05D32 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
CTDSPL2Q05D32 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CTDSPL2Q05D32 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CTDSPL2Q05D32 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CTDSPL2Q05D32 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CTDSPL2Q05D32 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CTDSPL2Q05D32 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CTDSPL2Q05D32 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CTDSPL2Q05D32 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CTDSPL2Q05D32 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CTDSPL2Q05D32 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CTDSPL2Q05D32 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CTDSPL2Q05D32 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CTDSPL2Q05D32 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CTDSPL2Q05D32 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CTDSPL2Q05D32 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CTDSPL2Q05D32 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CTDSPL2Q05D32 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CTDSPL2Q05D32 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CTDSPL2Q05D32 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CTDSPL2Q05D32 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CTDSPL2Q05D32 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CTDSPL2Q05D32 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CTDSPL2Q05D32 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CTDSPL2Q05D32 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CTDSPL2Q05D32 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
CTDSPL2Q05D32 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CTDSPL2Q05D32 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CTDSPL2Q05D32 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CTDSPL2Q05D32 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CTDSPL2Q05D32 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CTDSPL2Q05D32 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CTDSPL2Q05D32 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CTDSPL2Q05D32 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CTDSPL2Q05D32 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CTDSPL2Q05D32 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.5 ms