Protein–RNA interactions for Protein: Q05A13

Sdr16c6, Short-chain dehydrogenase/reductase family 16C member 6, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdr16c6Q05A13 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sdr16c6Q05A13 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sdr16c6Q05A13 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sdr16c6Q05A13 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sdr16c6Q05A13 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sdr16c6Q05A13 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sdr16c6Q05A13 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sdr16c6Q05A13 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sdr16c6Q05A13 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sdr16c6Q05A13 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sdr16c6Q05A13 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Sdr16c6Q05A13 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Sdr16c6Q05A13 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sdr16c6Q05A13 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sdr16c6Q05A13 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sdr16c6Q05A13 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sdr16c6Q05A13 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sdr16c6Q05A13 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sdr16c6Q05A13 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Sdr16c6Q05A13 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sdr16c6Q05A13 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Sdr16c6Q05A13 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sdr16c6Q05A13 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sdr16c6Q05A13 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sdr16c6Q05A13 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sdr16c6Q05A13 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sdr16c6Q05A13 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sdr16c6Q05A13 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sdr16c6Q05A13 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sdr16c6Q05A13 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sdr16c6Q05A13 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Sdr16c6Q05A13 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sdr16c6Q05A13 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sdr16c6Q05A13 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sdr16c6Q05A13 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sdr16c6Q05A13 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sdr16c6Q05A13 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sdr16c6Q05A13 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sdr16c6Q05A13 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sdr16c6Q05A13 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sdr16c6Q05A13 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sdr16c6Q05A13 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sdr16c6Q05A13 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sdr16c6Q05A13 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sdr16c6Q05A13 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sdr16c6Q05A13 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Sdr16c6Q05A13 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Sdr16c6Q05A13 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sdr16c6Q05A13 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sdr16c6Q05A13 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sdr16c6Q05A13 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sdr16c6Q05A13 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sdr16c6Q05A13 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sdr16c6Q05A13 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sdr16c6Q05A13 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sdr16c6Q05A13 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sdr16c6Q05A13 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Sdr16c6Q05A13 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sdr16c6Q05A13 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sdr16c6Q05A13 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sdr16c6Q05A13 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Sdr16c6Q05A13 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Sdr16c6Q05A13 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sdr16c6Q05A13 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sdr16c6Q05A13 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sdr16c6Q05A13 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sdr16c6Q05A13 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sdr16c6Q05A13 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sdr16c6Q05A13 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Sdr16c6Q05A13 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sdr16c6Q05A13 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sdr16c6Q05A13 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sdr16c6Q05A13 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sdr16c6Q05A13 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sdr16c6Q05A13 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sdr16c6Q05A13 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sdr16c6Q05A13 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sdr16c6Q05A13 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sdr16c6Q05A13 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sdr16c6Q05A13 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Sdr16c6Q05A13 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sdr16c6Q05A13 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sdr16c6Q05A13 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sdr16c6Q05A13 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sdr16c6Q05A13 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Sdr16c6Q05A13 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sdr16c6Q05A13 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Sdr16c6Q05A13 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sdr16c6Q05A13 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sdr16c6Q05A13 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sdr16c6Q05A13 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sdr16c6Q05A13 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sdr16c6Q05A13 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sdr16c6Q05A13 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sdr16c6Q05A13 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sdr16c6Q05A13 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sdr16c6Q05A13 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sdr16c6Q05A13 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sdr16c6Q05A13 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sdr16c6Q05A13 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms