Protein–RNA interactions for Protein: Q05909

Ptprg, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, mousemouse

Predictions only

Length 1,442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprgQ05909 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
PtprgQ05909 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
PtprgQ05909 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
PtprgQ05909 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
PtprgQ05909 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
PtprgQ05909 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
PtprgQ05909 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
PtprgQ05909 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
PtprgQ05909 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
PtprgQ05909 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
PtprgQ05909 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC30.45■■■□□ 2.46
PtprgQ05909 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC30.45■■■□□ 2.46
PtprgQ05909 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
PtprgQ05909 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
PtprgQ05909 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
PtprgQ05909 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
PtprgQ05909 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
PtprgQ05909 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
PtprgQ05909 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
PtprgQ05909 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
PtprgQ05909 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
PtprgQ05909 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
PtprgQ05909 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
PtprgQ05909 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
PtprgQ05909 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
PtprgQ05909 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
PtprgQ05909 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
PtprgQ05909 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
PtprgQ05909 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
PtprgQ05909 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
PtprgQ05909 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
PtprgQ05909 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
PtprgQ05909 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
PtprgQ05909 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
PtprgQ05909 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
PtprgQ05909 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
PtprgQ05909 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
PtprgQ05909 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PtprgQ05909 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PtprgQ05909 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PtprgQ05909 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC30.37■■■□□ 2.45
PtprgQ05909 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
PtprgQ05909 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
PtprgQ05909 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
PtprgQ05909 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
PtprgQ05909 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
PtprgQ05909 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
PtprgQ05909 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
PtprgQ05909 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
PtprgQ05909 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
PtprgQ05909 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
PtprgQ05909 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
PtprgQ05909 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
PtprgQ05909 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
PtprgQ05909 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
PtprgQ05909 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
PtprgQ05909 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
PtprgQ05909 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
PtprgQ05909 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
PtprgQ05909 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
PtprgQ05909 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
PtprgQ05909 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
PtprgQ05909 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC30.32■■■□□ 2.44
PtprgQ05909 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
PtprgQ05909 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
PtprgQ05909 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
PtprgQ05909 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
PtprgQ05909 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
PtprgQ05909 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
PtprgQ05909 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
PtprgQ05909 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
PtprgQ05909 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
PtprgQ05909 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
PtprgQ05909 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
PtprgQ05909 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
PtprgQ05909 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
PtprgQ05909 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
PtprgQ05909 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
PtprgQ05909 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
PtprgQ05909 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
PtprgQ05909 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
PtprgQ05909 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
PtprgQ05909 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
PtprgQ05909 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
PtprgQ05909 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
PtprgQ05909 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
PtprgQ05909 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
PtprgQ05909 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
PtprgQ05909 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
PtprgQ05909 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
PtprgQ05909 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
PtprgQ05909 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
PtprgQ05909 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
PtprgQ05909 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
PtprgQ05909 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
PtprgQ05909 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PtprgQ05909 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
PtprgQ05909 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PtprgQ05909 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PtprgQ05909 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.5 ms