Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
CALD1Q05682 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
CALD1Q05682 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
CALD1Q05682 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
CALD1Q05682 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
CALD1Q05682 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
CALD1Q05682 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
CALD1Q05682 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.47
CALD1Q05682 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
CALD1Q05682 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
CALD1Q05682 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
CALD1Q05682 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
CALD1Q05682 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
CALD1Q05682 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
CALD1Q05682 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
CALD1Q05682 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
CALD1Q05682 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CALD1Q05682 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
CALD1Q05682 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
CALD1Q05682 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC30.44■■■□□ 2.46
CALD1Q05682 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
CALD1Q05682 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CALD1Q05682 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CALD1Q05682 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
CALD1Q05682 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
CALD1Q05682 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
CALD1Q05682 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
CALD1Q05682 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
CALD1Q05682 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
CALD1Q05682 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CALD1Q05682 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CALD1Q05682 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
CALD1Q05682 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
CALD1Q05682 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CALD1Q05682 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CALD1Q05682 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CALD1Q05682 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.41■■■□□ 2.46
CALD1Q05682 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
CALD1Q05682 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
CALD1Q05682 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CALD1Q05682 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CALD1Q05682 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CALD1Q05682 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CALD1Q05682 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
CALD1Q05682 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CALD1Q05682 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CALD1Q05682 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CALD1Q05682 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
CALD1Q05682 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
CALD1Q05682 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
CALD1Q05682 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
CALD1Q05682 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.46
CALD1Q05682 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
CALD1Q05682 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
CALD1Q05682 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CALD1Q05682 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CALD1Q05682 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CALD1Q05682 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
CALD1Q05682 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CALD1Q05682 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
CALD1Q05682 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
CALD1Q05682 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
CALD1Q05682 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
CALD1Q05682 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
CALD1Q05682 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CALD1Q05682 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CALD1Q05682 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
CALD1Q05682 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
CALD1Q05682 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
CALD1Q05682 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
CALD1Q05682 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
CALD1Q05682 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
CALD1Q05682 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
CALD1Q05682 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
CALD1Q05682 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
CALD1Q05682 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
CALD1Q05682 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
CALD1Q05682 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
CALD1Q05682 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
CALD1Q05682 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
CALD1Q05682 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC30.33■■■□□ 2.45
CALD1Q05682 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
CALD1Q05682 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
CALD1Q05682 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
CALD1Q05682 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.45
CALD1Q05682 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
CALD1Q05682 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
CALD1Q05682 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
CALD1Q05682 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
CALD1Q05682 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
CALD1Q05682 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
CALD1Q05682 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
CALD1Q05682 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
CALD1Q05682 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
CALD1Q05682 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
CALD1Q05682 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
CALD1Q05682 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
CALD1Q05682 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
CALD1Q05682 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
CALD1Q05682 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms