Protein–RNA interactions for Protein: Q02956

Prkcz, Protein kinase C zeta type, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkczQ02956 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PrkczQ02956 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PrkczQ02956 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PrkczQ02956 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PrkczQ02956 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PrkczQ02956 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PrkczQ02956 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PrkczQ02956 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PrkczQ02956 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PrkczQ02956 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PrkczQ02956 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PrkczQ02956 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PrkczQ02956 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PrkczQ02956 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PrkczQ02956 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PrkczQ02956 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PrkczQ02956 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PrkczQ02956 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PrkczQ02956 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PrkczQ02956 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PrkczQ02956 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PrkczQ02956 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PrkczQ02956 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PrkczQ02956 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PrkczQ02956 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PrkczQ02956 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PrkczQ02956 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PrkczQ02956 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PrkczQ02956 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PrkczQ02956 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PrkczQ02956 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PrkczQ02956 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PrkczQ02956 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PrkczQ02956 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PrkczQ02956 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PrkczQ02956 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PrkczQ02956 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PrkczQ02956 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PrkczQ02956 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PrkczQ02956 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PrkczQ02956 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PrkczQ02956 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PrkczQ02956 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PrkczQ02956 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PrkczQ02956 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PrkczQ02956 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PrkczQ02956 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PrkczQ02956 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PrkczQ02956 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PrkczQ02956 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PrkczQ02956 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PrkczQ02956 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PrkczQ02956 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PrkczQ02956 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PrkczQ02956 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PrkczQ02956 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PrkczQ02956 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PrkczQ02956 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PrkczQ02956 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PrkczQ02956 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PrkczQ02956 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PrkczQ02956 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PrkczQ02956 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PrkczQ02956 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PrkczQ02956 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PrkczQ02956 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PrkczQ02956 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PrkczQ02956 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PrkczQ02956 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PrkczQ02956 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PrkczQ02956 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PrkczQ02956 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PrkczQ02956 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PrkczQ02956 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PrkczQ02956 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PrkczQ02956 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PrkczQ02956 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PrkczQ02956 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PrkczQ02956 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PrkczQ02956 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PrkczQ02956 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PrkczQ02956 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PrkczQ02956 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PrkczQ02956 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PrkczQ02956 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PrkczQ02956 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PrkczQ02956 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PrkczQ02956 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PrkczQ02956 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PrkczQ02956 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PrkczQ02956 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PrkczQ02956 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PrkczQ02956 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PrkczQ02956 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PrkczQ02956 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PrkczQ02956 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PrkczQ02956 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PrkczQ02956 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PrkczQ02956 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PrkczQ02956 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms