Protein–RNA interactions for Protein: Q02085

Snai1, Zinc finger protein SNAI1, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai1Q02085 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Snai1Q02085 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Snai1Q02085 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Snai1Q02085 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Snai1Q02085 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Snai1Q02085 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Snai1Q02085 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Snai1Q02085 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Snai1Q02085 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Snai1Q02085 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Snai1Q02085 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Snai1Q02085 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Snai1Q02085 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Snai1Q02085 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Snai1Q02085 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Snai1Q02085 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Snai1Q02085 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Snai1Q02085 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Snai1Q02085 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Snai1Q02085 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Snai1Q02085 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Snai1Q02085 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Snai1Q02085 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Snai1Q02085 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Snai1Q02085 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Snai1Q02085 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Snai1Q02085 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Snai1Q02085 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Snai1Q02085 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Snai1Q02085 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Snai1Q02085 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Snai1Q02085 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Snai1Q02085 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Snai1Q02085 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Snai1Q02085 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Snai1Q02085 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Snai1Q02085 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Snai1Q02085 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Snai1Q02085 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Snai1Q02085 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Snai1Q02085 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Snai1Q02085 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Snai1Q02085 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Snai1Q02085 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Snai1Q02085 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Snai1Q02085 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Snai1Q02085 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Snai1Q02085 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Snai1Q02085 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Snai1Q02085 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Snai1Q02085 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Snai1Q02085 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Snai1Q02085 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Snai1Q02085 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Snai1Q02085 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Snai1Q02085 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Snai1Q02085 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Snai1Q02085 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Snai1Q02085 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Snai1Q02085 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Snai1Q02085 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Snai1Q02085 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Snai1Q02085 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Snai1Q02085 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Snai1Q02085 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Snai1Q02085 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Snai1Q02085 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Snai1Q02085 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Snai1Q02085 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Snai1Q02085 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Snai1Q02085 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Snai1Q02085 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Snai1Q02085 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Snai1Q02085 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Snai1Q02085 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Snai1Q02085 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Snai1Q02085 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Snai1Q02085 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Snai1Q02085 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Snai1Q02085 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Snai1Q02085 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Snai1Q02085 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Snai1Q02085 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Snai1Q02085 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Snai1Q02085 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Snai1Q02085 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Snai1Q02085 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Snai1Q02085 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Snai1Q02085 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Snai1Q02085 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Snai1Q02085 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Snai1Q02085 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Snai1Q02085 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Snai1Q02085 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Snai1Q02085 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Snai1Q02085 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Snai1Q02085 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Snai1Q02085 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Snai1Q02085 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Snai1Q02085 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms