Protein–RNA interactions for Protein: Q01730

Rsu1, Ras suppressor protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsu1Q01730 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rsu1Q01730 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rsu1Q01730 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rsu1Q01730 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rsu1Q01730 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rsu1Q01730 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rsu1Q01730 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rsu1Q01730 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rsu1Q01730 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rsu1Q01730 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rsu1Q01730 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rsu1Q01730 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rsu1Q01730 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rsu1Q01730 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rsu1Q01730 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rsu1Q01730 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rsu1Q01730 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Rsu1Q01730 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rsu1Q01730 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rsu1Q01730 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rsu1Q01730 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rsu1Q01730 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rsu1Q01730 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rsu1Q01730 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rsu1Q01730 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rsu1Q01730 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rsu1Q01730 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Rsu1Q01730 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rsu1Q01730 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Rsu1Q01730 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rsu1Q01730 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rsu1Q01730 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rsu1Q01730 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rsu1Q01730 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rsu1Q01730 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rsu1Q01730 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rsu1Q01730 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rsu1Q01730 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Rsu1Q01730 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rsu1Q01730 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rsu1Q01730 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rsu1Q01730 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rsu1Q01730 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rsu1Q01730 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rsu1Q01730 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rsu1Q01730 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rsu1Q01730 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rsu1Q01730 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rsu1Q01730 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rsu1Q01730 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rsu1Q01730 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rsu1Q01730 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rsu1Q01730 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Rsu1Q01730 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rsu1Q01730 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rsu1Q01730 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rsu1Q01730 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rsu1Q01730 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rsu1Q01730 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rsu1Q01730 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rsu1Q01730 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rsu1Q01730 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Rsu1Q01730 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rsu1Q01730 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rsu1Q01730 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rsu1Q01730 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Rsu1Q01730 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Rsu1Q01730 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rsu1Q01730 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rsu1Q01730 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rsu1Q01730 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rsu1Q01730 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rsu1Q01730 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rsu1Q01730 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rsu1Q01730 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rsu1Q01730 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Rsu1Q01730 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rsu1Q01730 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Rsu1Q01730 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rsu1Q01730 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rsu1Q01730 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rsu1Q01730 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rsu1Q01730 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rsu1Q01730 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rsu1Q01730 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rsu1Q01730 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rsu1Q01730 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rsu1Q01730 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rsu1Q01730 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rsu1Q01730 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rsu1Q01730 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rsu1Q01730 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rsu1Q01730 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rsu1Q01730 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rsu1Q01730 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rsu1Q01730 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rsu1Q01730 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rsu1Q01730 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rsu1Q01730 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Rsu1Q01730 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms