Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
E2F1Q01094 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
E2F1Q01094 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
E2F1Q01094 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
E2F1Q01094 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
E2F1Q01094 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
E2F1Q01094 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
E2F1Q01094 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
E2F1Q01094 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
E2F1Q01094 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
E2F1Q01094 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
E2F1Q01094 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
E2F1Q01094 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
E2F1Q01094 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
E2F1Q01094 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
E2F1Q01094 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
E2F1Q01094 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
E2F1Q01094 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
E2F1Q01094 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
E2F1Q01094 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
E2F1Q01094 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
E2F1Q01094 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
E2F1Q01094 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
E2F1Q01094 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
E2F1Q01094 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
E2F1Q01094 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
E2F1Q01094 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
E2F1Q01094 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
E2F1Q01094 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
E2F1Q01094 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
E2F1Q01094 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
E2F1Q01094 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
E2F1Q01094 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
E2F1Q01094 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
E2F1Q01094 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
E2F1Q01094 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
E2F1Q01094 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
E2F1Q01094 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
E2F1Q01094 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
E2F1Q01094 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
E2F1Q01094 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
E2F1Q01094 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
E2F1Q01094 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
E2F1Q01094 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
E2F1Q01094 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
E2F1Q01094 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
E2F1Q01094 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
E2F1Q01094 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
E2F1Q01094 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
E2F1Q01094 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
E2F1Q01094 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
E2F1Q01094 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
E2F1Q01094 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
E2F1Q01094 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
E2F1Q01094 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
E2F1Q01094 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
E2F1Q01094 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
E2F1Q01094 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
E2F1Q01094 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
E2F1Q01094 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
E2F1Q01094 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
E2F1Q01094 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
E2F1Q01094 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
E2F1Q01094 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
E2F1Q01094 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
E2F1Q01094 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
E2F1Q01094 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
E2F1Q01094 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
E2F1Q01094 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
E2F1Q01094 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
E2F1Q01094 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
E2F1Q01094 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
E2F1Q01094 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
E2F1Q01094 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
E2F1Q01094 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
E2F1Q01094 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
E2F1Q01094 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
E2F1Q01094 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
E2F1Q01094 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
E2F1Q01094 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
E2F1Q01094 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
E2F1Q01094 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
E2F1Q01094 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
E2F1Q01094 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
E2F1Q01094 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
E2F1Q01094 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
E2F1Q01094 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
E2F1Q01094 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
E2F1Q01094 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
E2F1Q01094 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
E2F1Q01094 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
E2F1Q01094 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
E2F1Q01094 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
E2F1Q01094 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
E2F1Q01094 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
E2F1Q01094 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
E2F1Q01094 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
E2F1Q01094 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
E2F1Q01094 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
E2F1Q01094 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms