Protein–RNA interactions for Protein: Q01064

PDE1B, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, humanhuman

Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE1BQ01064 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDE1BQ01064 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDE1BQ01064 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDE1BQ01064 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDE1BQ01064 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDE1BQ01064 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDE1BQ01064 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDE1BQ01064 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDE1BQ01064 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDE1BQ01064 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDE1BQ01064 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDE1BQ01064 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDE1BQ01064 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDE1BQ01064 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDE1BQ01064 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PDE1BQ01064 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDE1BQ01064 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDE1BQ01064 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDE1BQ01064 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDE1BQ01064 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDE1BQ01064 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDE1BQ01064 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDE1BQ01064 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDE1BQ01064 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDE1BQ01064 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDE1BQ01064 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDE1BQ01064 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDE1BQ01064 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDE1BQ01064 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDE1BQ01064 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDE1BQ01064 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDE1BQ01064 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDE1BQ01064 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDE1BQ01064 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDE1BQ01064 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDE1BQ01064 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDE1BQ01064 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDE1BQ01064 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDE1BQ01064 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDE1BQ01064 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDE1BQ01064 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PDE1BQ01064 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDE1BQ01064 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDE1BQ01064 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDE1BQ01064 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDE1BQ01064 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDE1BQ01064 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDE1BQ01064 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDE1BQ01064 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDE1BQ01064 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PDE1BQ01064 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDE1BQ01064 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDE1BQ01064 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDE1BQ01064 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDE1BQ01064 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDE1BQ01064 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDE1BQ01064 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDE1BQ01064 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDE1BQ01064 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PDE1BQ01064 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PDE1BQ01064 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PDE1BQ01064 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PDE1BQ01064 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PDE1BQ01064 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PDE1BQ01064 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PDE1BQ01064 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PDE1BQ01064 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PDE1BQ01064 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PDE1BQ01064 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PDE1BQ01064 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PDE1BQ01064 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDE1BQ01064 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDE1BQ01064 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDE1BQ01064 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDE1BQ01064 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDE1BQ01064 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDE1BQ01064 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDE1BQ01064 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDE1BQ01064 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDE1BQ01064 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDE1BQ01064 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDE1BQ01064 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDE1BQ01064 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PDE1BQ01064 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDE1BQ01064 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDE1BQ01064 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDE1BQ01064 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDE1BQ01064 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDE1BQ01064 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDE1BQ01064 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDE1BQ01064 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDE1BQ01064 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDE1BQ01064 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDE1BQ01064 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDE1BQ01064 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDE1BQ01064 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDE1BQ01064 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDE1BQ01064 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDE1BQ01064 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PDE1BQ01064 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1386.7 ms