Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM3AP98173 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM3AP98173 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM3AP98173 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM3AP98173 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM3AP98173 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM3AP98173 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM3AP98173 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM3AP98173 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM3AP98173 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAM3AP98173 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAM3AP98173 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAM3AP98173 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAM3AP98173 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAM3AP98173 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAM3AP98173 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM3AP98173 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM3AP98173 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM3AP98173 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM3AP98173 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM3AP98173 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM3AP98173 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM3AP98173 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM3AP98173 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM3AP98173 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM3AP98173 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM3AP98173 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM3AP98173 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM3AP98173 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM3AP98173 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM3AP98173 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM3AP98173 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM3AP98173 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM3AP98173 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM3AP98173 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM3AP98173 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM3AP98173 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM3AP98173 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
FAM3AP98173 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
FAM3AP98173 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM3AP98173 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM3AP98173 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM3AP98173 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM3AP98173 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM3AP98173 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM3AP98173 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM3AP98173 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM3AP98173 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM3AP98173 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM3AP98173 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM3AP98173 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM3AP98173 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM3AP98173 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM3AP98173 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM3AP98173 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM3AP98173 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM3AP98173 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM3AP98173 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM3AP98173 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM3AP98173 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM3AP98173 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM3AP98173 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM3AP98173 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM3AP98173 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM3AP98173 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM3AP98173 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM3AP98173 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM3AP98173 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM3AP98173 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM3AP98173 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM3AP98173 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM3AP98173 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM3AP98173 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM3AP98173 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM3AP98173 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM3AP98173 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM3AP98173 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM3AP98173 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM3AP98173 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM3AP98173 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM3AP98173 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM3AP98173 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM3AP98173 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM3AP98173 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM3AP98173 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM3AP98173 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM3AP98173 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM3AP98173 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM3AP98173 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM3AP98173 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM3AP98173 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM3AP98173 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM3AP98173 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM3AP98173 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM3AP98173 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM3AP98173 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM3AP98173 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM3AP98173 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM3AP98173 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM3AP98173 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.5 ms