Protein–RNA interactions for Protein: P98172

EFNB1, Ephrin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB1P98172 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
EFNB1P98172 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
EFNB1P98172 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
EFNB1P98172 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
EFNB1P98172 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
EFNB1P98172 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
EFNB1P98172 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
EFNB1P98172 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
EFNB1P98172 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
EFNB1P98172 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
EFNB1P98172 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
EFNB1P98172 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
EFNB1P98172 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
EFNB1P98172 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
EFNB1P98172 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
EFNB1P98172 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
EFNB1P98172 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
EFNB1P98172 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
EFNB1P98172 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
EFNB1P98172 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
EFNB1P98172 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
EFNB1P98172 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
EFNB1P98172 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
EFNB1P98172 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
EFNB1P98172 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
EFNB1P98172 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
EFNB1P98172 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
EFNB1P98172 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
EFNB1P98172 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
EFNB1P98172 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
EFNB1P98172 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
EFNB1P98172 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
EFNB1P98172 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
EFNB1P98172 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
EFNB1P98172 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
EFNB1P98172 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
EFNB1P98172 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
EFNB1P98172 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
EFNB1P98172 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
EFNB1P98172 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
EFNB1P98172 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
EFNB1P98172 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
EFNB1P98172 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
EFNB1P98172 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
EFNB1P98172 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
EFNB1P98172 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
EFNB1P98172 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
EFNB1P98172 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
EFNB1P98172 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
EFNB1P98172 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
EFNB1P98172 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
EFNB1P98172 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
EFNB1P98172 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
EFNB1P98172 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
EFNB1P98172 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
EFNB1P98172 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
EFNB1P98172 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
EFNB1P98172 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
EFNB1P98172 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
EFNB1P98172 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
EFNB1P98172 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
EFNB1P98172 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
EFNB1P98172 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
EFNB1P98172 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
EFNB1P98172 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
EFNB1P98172 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
EFNB1P98172 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
EFNB1P98172 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
EFNB1P98172 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
EFNB1P98172 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
EFNB1P98172 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
EFNB1P98172 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
EFNB1P98172 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
EFNB1P98172 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
EFNB1P98172 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
EFNB1P98172 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
EFNB1P98172 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
EFNB1P98172 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
EFNB1P98172 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
EFNB1P98172 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
EFNB1P98172 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
EFNB1P98172 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
EFNB1P98172 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
EFNB1P98172 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
EFNB1P98172 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
EFNB1P98172 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
EFNB1P98172 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
EFNB1P98172 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
EFNB1P98172 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
EFNB1P98172 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
EFNB1P98172 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
EFNB1P98172 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
EFNB1P98172 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
EFNB1P98172 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
EFNB1P98172 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
EFNB1P98172 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
EFNB1P98172 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
EFNB1P98172 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
EFNB1P98172 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
EFNB1P98172 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms