Protein–RNA interactions for Protein: P97798

Neo1, Neogenin, mousemouse

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neo1P97798 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
Neo1P97798 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Neo1P97798 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Neo1P97798 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Neo1P97798 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Neo1P97798 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
Neo1P97798 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Neo1P97798 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Neo1P97798 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
Neo1P97798 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
Neo1P97798 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Neo1P97798 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Neo1P97798 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Neo1P97798 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC33.15■■■□□ 2.9
Neo1P97798 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
Neo1P97798 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Neo1P97798 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Neo1P97798 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
Neo1P97798 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
Neo1P97798 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Neo1P97798 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Neo1P97798 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Neo1P97798 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Neo1P97798 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
Neo1P97798 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
Neo1P97798 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
Neo1P97798 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Neo1P97798 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC33.13■■■□□ 2.89
Neo1P97798 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Neo1P97798 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC33.12■■■□□ 2.89
Neo1P97798 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Neo1P97798 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Neo1P97798 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
Neo1P97798 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.12■■■□□ 2.89
Neo1P97798 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
Neo1P97798 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Neo1P97798 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Neo1P97798 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Neo1P97798 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Neo1P97798 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
Neo1P97798 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
Neo1P97798 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Neo1P97798 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Neo1P97798 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC33.1■■■□□ 2.89
Neo1P97798 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
Neo1P97798 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Neo1P97798 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Neo1P97798 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Neo1P97798 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Neo1P97798 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
Neo1P97798 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
Neo1P97798 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
Neo1P97798 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Neo1P97798 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Neo1P97798 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
Neo1P97798 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Neo1P97798 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC33.07■■■□□ 2.88
Neo1P97798 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Neo1P97798 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
Neo1P97798 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Neo1P97798 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Neo1P97798 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
Neo1P97798 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC33.06■■■□□ 2.88
Neo1P97798 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Neo1P97798 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
Neo1P97798 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC33.05■■■□□ 2.88
Neo1P97798 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Neo1P97798 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Neo1P97798 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Neo1P97798 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
Neo1P97798 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Neo1P97798 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
Neo1P97798 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Neo1P97798 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Neo1P97798 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Neo1P97798 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Neo1P97798 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Neo1P97798 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Neo1P97798 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Neo1P97798 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
Neo1P97798 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
Neo1P97798 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Neo1P97798 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Neo1P97798 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC33■■■□□ 2.87
Neo1P97798 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Neo1P97798 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Neo1P97798 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Neo1P97798 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Neo1P97798 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC32.99■■■□□ 2.87
Neo1P97798 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Neo1P97798 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Neo1P97798 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Neo1P97798 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Neo1P97798 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Neo1P97798 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Neo1P97798 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC32.98■■■□□ 2.87
Neo1P97798 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Neo1P97798 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
Neo1P97798 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Neo1P97798 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112.1 ms