Protein–RNA interactions for Protein: P97785

Gfra1, GDNF family receptor alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra1P97785 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gfra1P97785 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gfra1P97785 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gfra1P97785 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gfra1P97785 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gfra1P97785 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gfra1P97785 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gfra1P97785 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Gfra1P97785 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gfra1P97785 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gfra1P97785 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gfra1P97785 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gfra1P97785 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gfra1P97785 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gfra1P97785 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gfra1P97785 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gfra1P97785 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gfra1P97785 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gfra1P97785 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gfra1P97785 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Gfra1P97785 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gfra1P97785 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gfra1P97785 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gfra1P97785 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gfra1P97785 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gfra1P97785 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gfra1P97785 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gfra1P97785 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gfra1P97785 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gfra1P97785 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gfra1P97785 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gfra1P97785 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gfra1P97785 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gfra1P97785 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gfra1P97785 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gfra1P97785 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gfra1P97785 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gfra1P97785 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gfra1P97785 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gfra1P97785 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gfra1P97785 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gfra1P97785 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gfra1P97785 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gfra1P97785 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gfra1P97785 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gfra1P97785 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gfra1P97785 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gfra1P97785 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gfra1P97785 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Gfra1P97785 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Gfra1P97785 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gfra1P97785 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gfra1P97785 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gfra1P97785 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gfra1P97785 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gfra1P97785 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gfra1P97785 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gfra1P97785 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gfra1P97785 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Gfra1P97785 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gfra1P97785 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gfra1P97785 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gfra1P97785 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gfra1P97785 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gfra1P97785 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gfra1P97785 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gfra1P97785 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gfra1P97785 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gfra1P97785 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gfra1P97785 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gfra1P97785 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gfra1P97785 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gfra1P97785 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gfra1P97785 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gfra1P97785 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gfra1P97785 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gfra1P97785 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gfra1P97785 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gfra1P97785 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gfra1P97785 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gfra1P97785 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Gfra1P97785 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gfra1P97785 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gfra1P97785 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gfra1P97785 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gfra1P97785 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gfra1P97785 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gfra1P97785 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gfra1P97785 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gfra1P97785 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gfra1P97785 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gfra1P97785 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gfra1P97785 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gfra1P97785 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gfra1P97785 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gfra1P97785 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gfra1P97785 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gfra1P97785 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gfra1P97785 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gfra1P97785 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms