Protein–RNA interactions for Protein: P83917

Cbx1, Chromobox protein homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx1P83917 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cbx1P83917 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cbx1P83917 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cbx1P83917 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cbx1P83917 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cbx1P83917 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cbx1P83917 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cbx1P83917 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cbx1P83917 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cbx1P83917 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cbx1P83917 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cbx1P83917 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cbx1P83917 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cbx1P83917 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cbx1P83917 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cbx1P83917 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cbx1P83917 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cbx1P83917 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cbx1P83917 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cbx1P83917 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cbx1P83917 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cbx1P83917 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cbx1P83917 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cbx1P83917 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cbx1P83917 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cbx1P83917 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cbx1P83917 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cbx1P83917 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cbx1P83917 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cbx1P83917 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cbx1P83917 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cbx1P83917 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cbx1P83917 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cbx1P83917 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cbx1P83917 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cbx1P83917 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cbx1P83917 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cbx1P83917 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cbx1P83917 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cbx1P83917 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cbx1P83917 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cbx1P83917 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cbx1P83917 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cbx1P83917 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cbx1P83917 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cbx1P83917 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cbx1P83917 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cbx1P83917 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cbx1P83917 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cbx1P83917 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cbx1P83917 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cbx1P83917 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cbx1P83917 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cbx1P83917 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cbx1P83917 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cbx1P83917 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cbx1P83917 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cbx1P83917 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cbx1P83917 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cbx1P83917 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cbx1P83917 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cbx1P83917 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cbx1P83917 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cbx1P83917 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cbx1P83917 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cbx1P83917 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cbx1P83917 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cbx1P83917 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cbx1P83917 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cbx1P83917 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cbx1P83917 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cbx1P83917 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cbx1P83917 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cbx1P83917 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cbx1P83917 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cbx1P83917 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cbx1P83917 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cbx1P83917 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cbx1P83917 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cbx1P83917 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cbx1P83917 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cbx1P83917 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cbx1P83917 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cbx1P83917 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cbx1P83917 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cbx1P83917 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cbx1P83917 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cbx1P83917 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cbx1P83917 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Cbx1P83917 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cbx1P83917 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cbx1P83917 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cbx1P83917 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cbx1P83917 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cbx1P83917 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cbx1P83917 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cbx1P83917 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cbx1P83917 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cbx1P83917 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cbx1P83917 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms