Protein–RNA interactions for Protein: P78411

IRX5, Iroquois-class homeodomain protein IRX-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 483 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX5P78411 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
IRX5P78411 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
IRX5P78411 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
IRX5P78411 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
IRX5P78411 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
IRX5P78411 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
IRX5P78411 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
IRX5P78411 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
IRX5P78411 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
IRX5P78411 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
IRX5P78411 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
IRX5P78411 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
IRX5P78411 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
IRX5P78411 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
IRX5P78411 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
IRX5P78411 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
IRX5P78411 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
IRX5P78411 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
IRX5P78411 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
IRX5P78411 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
IRX5P78411 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
IRX5P78411 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
IRX5P78411 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
IRX5P78411 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
IRX5P78411 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
IRX5P78411 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
IRX5P78411 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
IRX5P78411 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
IRX5P78411 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
IRX5P78411 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
IRX5P78411 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
IRX5P78411 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
IRX5P78411 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
IRX5P78411 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
IRX5P78411 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
IRX5P78411 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
IRX5P78411 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
IRX5P78411 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
IRX5P78411 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
IRX5P78411 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
IRX5P78411 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
IRX5P78411 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
IRX5P78411 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
IRX5P78411 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
IRX5P78411 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
IRX5P78411 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
IRX5P78411 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
IRX5P78411 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
IRX5P78411 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
IRX5P78411 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
IRX5P78411 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
IRX5P78411 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
IRX5P78411 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
IRX5P78411 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
IRX5P78411 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
IRX5P78411 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
IRX5P78411 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
IRX5P78411 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
IRX5P78411 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
IRX5P78411 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
IRX5P78411 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
IRX5P78411 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
IRX5P78411 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
IRX5P78411 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
IRX5P78411 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
IRX5P78411 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
IRX5P78411 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
IRX5P78411 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
IRX5P78411 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
IRX5P78411 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
IRX5P78411 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
IRX5P78411 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
IRX5P78411 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
IRX5P78411 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
IRX5P78411 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
IRX5P78411 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
IRX5P78411 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
IRX5P78411 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
IRX5P78411 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
IRX5P78411 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
IRX5P78411 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
IRX5P78411 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
IRX5P78411 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
IRX5P78411 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
IRX5P78411 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
IRX5P78411 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
IRX5P78411 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
IRX5P78411 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
IRX5P78411 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
IRX5P78411 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
IRX5P78411 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
IRX5P78411 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
IRX5P78411 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
IRX5P78411 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
IRX5P78411 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
IRX5P78411 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
IRX5P78411 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
IRX5P78411 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
IRX5P78411 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
IRX5P78411 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms