Protein–RNA interactions for Protein: P78396

CCNA1, Cyclin-A1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA1P78396 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCNA1P78396 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCNA1P78396 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
CCNA1P78396 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCNA1P78396 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCNA1P78396 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
CCNA1P78396 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCNA1P78396 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCNA1P78396 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCNA1P78396 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCNA1P78396 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCNA1P78396 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCNA1P78396 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCNA1P78396 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCNA1P78396 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCNA1P78396 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCNA1P78396 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCNA1P78396 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCNA1P78396 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCNA1P78396 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCNA1P78396 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCNA1P78396 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCNA1P78396 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCNA1P78396 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCNA1P78396 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCNA1P78396 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCNA1P78396 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCNA1P78396 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCNA1P78396 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CCNA1P78396 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCNA1P78396 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCNA1P78396 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCNA1P78396 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCNA1P78396 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CCNA1P78396 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCNA1P78396 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCNA1P78396 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCNA1P78396 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCNA1P78396 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCNA1P78396 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCNA1P78396 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCNA1P78396 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CCNA1P78396 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CCNA1P78396 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
CCNA1P78396 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCNA1P78396 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCNA1P78396 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCNA1P78396 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCNA1P78396 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCNA1P78396 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCNA1P78396 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCNA1P78396 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCNA1P78396 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCNA1P78396 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CCNA1P78396 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCNA1P78396 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCNA1P78396 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCNA1P78396 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCNA1P78396 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCNA1P78396 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCNA1P78396 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCNA1P78396 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCNA1P78396 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CCNA1P78396 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCNA1P78396 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCNA1P78396 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCNA1P78396 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCNA1P78396 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCNA1P78396 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCNA1P78396 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCNA1P78396 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCNA1P78396 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCNA1P78396 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCNA1P78396 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCNA1P78396 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CCNA1P78396 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCNA1P78396 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCNA1P78396 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCNA1P78396 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCNA1P78396 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCNA1P78396 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCNA1P78396 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCNA1P78396 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCNA1P78396 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCNA1P78396 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCNA1P78396 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCNA1P78396 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCNA1P78396 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CCNA1P78396 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCNA1P78396 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCNA1P78396 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCNA1P78396 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCNA1P78396 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCNA1P78396 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCNA1P78396 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CCNA1P78396 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CCNA1P78396 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CCNA1P78396 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCNA1P78396 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CCNA1P78396 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms