Protein–RNA interactions for Protein: P78364

PHC1, Polyhomeotic-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHC1P78364 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHC1P78364 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHC1P78364 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHC1P78364 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHC1P78364 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHC1P78364 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHC1P78364 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHC1P78364 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHC1P78364 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PHC1P78364 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHC1P78364 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHC1P78364 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PHC1P78364 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHC1P78364 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHC1P78364 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHC1P78364 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHC1P78364 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHC1P78364 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHC1P78364 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHC1P78364 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHC1P78364 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHC1P78364 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHC1P78364 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHC1P78364 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHC1P78364 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHC1P78364 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHC1P78364 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHC1P78364 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHC1P78364 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHC1P78364 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHC1P78364 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHC1P78364 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHC1P78364 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHC1P78364 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHC1P78364 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHC1P78364 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHC1P78364 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHC1P78364 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHC1P78364 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHC1P78364 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHC1P78364 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHC1P78364 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHC1P78364 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHC1P78364 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHC1P78364 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHC1P78364 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHC1P78364 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHC1P78364 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHC1P78364 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PHC1P78364 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PHC1P78364 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PHC1P78364 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PHC1P78364 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PHC1P78364 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PHC1P78364 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PHC1P78364 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PHC1P78364 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PHC1P78364 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PHC1P78364 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHC1P78364 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHC1P78364 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHC1P78364 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHC1P78364 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHC1P78364 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PHC1P78364 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHC1P78364 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHC1P78364 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHC1P78364 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHC1P78364 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHC1P78364 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PHC1P78364 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHC1P78364 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHC1P78364 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHC1P78364 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHC1P78364 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHC1P78364 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHC1P78364 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHC1P78364 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHC1P78364 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHC1P78364 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PHC1P78364 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHC1P78364 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHC1P78364 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHC1P78364 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHC1P78364 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHC1P78364 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHC1P78364 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHC1P78364 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHC1P78364 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHC1P78364 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHC1P78364 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHC1P78364 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHC1P78364 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHC1P78364 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHC1P78364 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHC1P78364 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHC1P78364 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHC1P78364 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHC1P78364 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHC1P78364 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms