Protein–RNA interactions for Protein: P70298

Cux2, Homeobox protein cut-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux2P70298 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
Cux2P70298 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC35.65■■■■□ 3.3
Cux2P70298 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC35.65■■■■□ 3.3
Cux2P70298 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
Cux2P70298 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Cux2P70298 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Cux2P70298 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC35.64■■■■□ 3.3
Cux2P70298 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.64■■■■□ 3.3
Cux2P70298 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC35.64■■■■□ 3.3
Cux2P70298 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
Cux2P70298 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
Cux2P70298 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Cux2P70298 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Cux2P70298 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Cux2P70298 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
Cux2P70298 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
Cux2P70298 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Cux2P70298 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC35.59■■■■□ 3.29
Cux2P70298 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC35.59■■■■□ 3.29
Cux2P70298 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.59■■■■□ 3.29
Cux2P70298 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Cux2P70298 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC35.59■■■■□ 3.29
Cux2P70298 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC35.59■■■■□ 3.29
Cux2P70298 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Cux2P70298 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC35.58■■■■□ 3.29
Cux2P70298 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Cux2P70298 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC35.57■■■■□ 3.29
Cux2P70298 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC35.57■■■■□ 3.29
Cux2P70298 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC35.57■■■■□ 3.29
Cux2P70298 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC35.57■■■■□ 3.29
Cux2P70298 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
Cux2P70298 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC35.57■■■■□ 3.28
Cux2P70298 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC35.57■■■■□ 3.28
Cux2P70298 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
Cux2P70298 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC35.57■■■■□ 3.28
Cux2P70298 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
Cux2P70298 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
Cux2P70298 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Cux2P70298 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Cux2P70298 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC35.56■■■■□ 3.28
Cux2P70298 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
Cux2P70298 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
Cux2P70298 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Cux2P70298 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Cux2P70298 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Cux2P70298 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
Cux2P70298 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Cux2P70298 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC35.53■■■■□ 3.28
Cux2P70298 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC35.53■■■■□ 3.28
Cux2P70298 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Cux2P70298 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Cux2P70298 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
Cux2P70298 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.52■■■■□ 3.28
Cux2P70298 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
Cux2P70298 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
Cux2P70298 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.28
Cux2P70298 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
Cux2P70298 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
Cux2P70298 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Cux2P70298 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Cux2P70298 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Cux2P70298 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Cux2P70298 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
Cux2P70298 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Cux2P70298 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
Cux2P70298 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Cux2P70298 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Cux2P70298 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Cux2P70298 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Cux2P70298 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC35.48■■■■□ 3.27
Cux2P70298 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Cux2P70298 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Cux2P70298 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
Cux2P70298 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC35.46■■■■□ 3.27
Cux2P70298 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.26
Cux2P70298 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
Cux2P70298 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
Cux2P70298 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.44■■■■□ 3.26
Cux2P70298 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
Cux2P70298 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
Cux2P70298 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Cux2P70298 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Cux2P70298 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Cux2P70298 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Cux2P70298 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Cux2P70298 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Cux2P70298 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC35.42■■■■□ 3.26
Cux2P70298 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Cux2P70298 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC35.42■■■■□ 3.26
Cux2P70298 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Cux2P70298 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC35.41■■■■□ 3.26
Cux2P70298 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC35.41■■■■□ 3.26
Cux2P70298 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC35.41■■■■□ 3.26
Cux2P70298 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
Cux2P70298 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Cux2P70298 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Cux2P70298 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Cux2P70298 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC35.4■■■■□ 3.26
Cux2P70298 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Cux2P70298 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms