Protein–RNA interactions for Protein: P68134

Acta1, Actin, alpha skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acta1P68134 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Acta1P68134 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Acta1P68134 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Acta1P68134 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Acta1P68134 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Acta1P68134 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Acta1P68134 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Acta1P68134 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Acta1P68134 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Acta1P68134 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Acta1P68134 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Acta1P68134 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Acta1P68134 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Acta1P68134 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Acta1P68134 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Acta1P68134 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Acta1P68134 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Acta1P68134 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Acta1P68134 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Acta1P68134 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Acta1P68134 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Acta1P68134 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Acta1P68134 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Acta1P68134 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Acta1P68134 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Acta1P68134 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Acta1P68134 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Acta1P68134 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Acta1P68134 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Acta1P68134 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Acta1P68134 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Acta1P68134 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Acta1P68134 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Acta1P68134 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Acta1P68134 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Acta1P68134 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Acta1P68134 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Acta1P68134 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Acta1P68134 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Acta1P68134 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Acta1P68134 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Acta1P68134 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Acta1P68134 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Acta1P68134 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Acta1P68134 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Acta1P68134 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Acta1P68134 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Acta1P68134 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Acta1P68134 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Acta1P68134 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Acta1P68134 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Acta1P68134 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Acta1P68134 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Acta1P68134 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Acta1P68134 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Acta1P68134 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Acta1P68134 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Acta1P68134 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Acta1P68134 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Acta1P68134 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Acta1P68134 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Acta1P68134 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Acta1P68134 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Acta1P68134 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Acta1P68134 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Acta1P68134 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Acta1P68134 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Acta1P68134 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Acta1P68134 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Acta1P68134 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Acta1P68134 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Acta1P68134 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Acta1P68134 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Acta1P68134 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Acta1P68134 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Acta1P68134 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Acta1P68134 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Acta1P68134 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Acta1P68134 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Acta1P68134 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Acta1P68134 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Acta1P68134 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Acta1P68134 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Acta1P68134 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Acta1P68134 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Acta1P68134 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Acta1P68134 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Acta1P68134 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Acta1P68134 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Acta1P68134 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Acta1P68134 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Acta1P68134 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Acta1P68134 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Acta1P68134 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Acta1P68134 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Acta1P68134 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Acta1P68134 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Acta1P68134 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Acta1P68134 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Acta1P68134 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms